軟件準(zhǔn)備：GeneDoc下載地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
發(fā)簡信
IP屬地：浙江
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利用GeneDoc美化同源比對(duì)結(jié)果 -
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使用MAKER進(jìn)行基因注釋(高級(jí)篇之GeneMark-ET模型訓(xùn)練）GeneMarkGeorgia Institute of Technology開發(fā)的一系列基因預(yù)測工具。真核生物基因組預(yù)測主要會(huì)用到GeneMark-ES/ET, 其中Gen...
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使用MAKER進(jìn)行基因注釋(高級(jí)篇之SNAP模型訓(xùn)練）
訓(xùn)練 ab initio 基因預(yù)測工具(以SNAP為例) 對(duì)于一個(gè)新的物種而言，你大概率是沒有一個(gè)高質(zhì)量的基因模型去進(jìn)行基因預(yù)測。但是我們可以利用EST序列（少部分物種估計(jì)有...
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maker注釋篇二(ID轉(zhuǎn)換)
基于上一步我們獲得了初步的gff及rna和蛋白文件，maker生成的文件id是默認(rèn)的，我們可以用maker自帶的腳本進(jìn)行更改。 生成maker默認(rèn)id和需要改的id的對(duì)應(yīng)關(guān)系...
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2020-09-07 MAKER Turorial 2013
關(guān)于MAKER MAKER是一款易于使用的基因組注釋管道軟件，在小型或大型科研項(xiàng)目都適于使用。MAKER既可用于對(duì)于新研究生物基因組進(jìn)行de novo注釋以為更新注釋提供證據(jù)...
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基因注釋：基于SNAP+Augustus+GeneMark的maker3 pipeline
我使用的maker版本為3.01.04 第一輪：將已知基因比對(duì)到基因組 包括兩個(gè)部分：??屏蔽重復(fù)序列??將已知的轉(zhuǎn)錄組/蛋白序列與基因組進(jìn)行比對(duì) 1.（可選）構(gòu)建自定義重復(fù)序列...
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基因注釋：MAKER3安裝（非root）
在該頁面登記后會(huì)彈出下載鏈接：http://weatherby.genetics.utah.edu/cgi-bin/registration/maker_license.cg...
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我的生信自學(xué)心得分享
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開始自學(xué)生物信息，那個(gè)時(shí)候，為了加深自己學(xué)習(xí)，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記。 我有一個(gè)自己的博客，xu...
