感謝，避雷了屬于是
NR數(shù)據(jù)庫的下載最近想要用blast找一些同源蛋白，由于網(wǎng)站上的blast給出的信息實(shí)在是很難提取啊，萌生了入坑本地blast的想法，之前已經(jīng)下載過blast本地軟件了，因此這次需要用到的東...
IP屬地：英格蘭
-
-
生物信息小菜鳥記錄遇到的問題，避免再次遇到的時(shí)候遺忘
-
NR數(shù)據(jù)庫的下載最近想要用blast找一些同源蛋白，由于網(wǎng)站上的blast給出的信息實(shí)在是很難提取啊，萌生了入坑本地blast的想法，之前已經(jīng)下載過blast本地軟件了，因此這次需要用到的東...
-
methylKit甲基化分析
引言 methylKit是一個(gè)R軟件包，用于分析和注釋通過高通量亞硫酸氫鹽測序獲得的DNA甲基化信息。該軟件包旨在處理RRBS及其變體的測序數(shù)據(jù)。但是，如果提供正確的輸入格式...
-
論文研讀：bioinfomatics|CGmapTools improves the precision of heterozygous SNV calls and supports allel...今天所讀的論文題目是《CGmapTools improves the precision of heterozygous SNV calls and supports all...
-
SSH超時(shí)斷開(ClientAliveInterval和ClientAliveCountMax )的使用
問題詳解：ssh遠(yuǎn)程登錄centos系統(tǒng)，離開一段時(shí)間后，ssh窗口自動斷開，有時(shí)會影響前臺運(yùn)行的任務(wù)，故而進(jìn)行解決。1、我們編輯sshd_config文件。vim /etc...
-
連雨不知春去，一晴方覺夏深
-
用R語言對vcf文件進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘.5 vcf可視化1目錄 前言[http://www.itdecent.cn/p/729673778e43] 方法簡介[http://www.itdecent.cn/p/d9bd081763...
-
序列比對軟件 MUMmer 結(jié)果文件解讀（三）該系列主要介紹了 MUMmer 軟件下核苷酸序列比對程序 nucmer 的使用，計(jì)算操作見前兩篇推文； 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[https://www.j...
-
序列比對軟件 MUMmer 簡單上手（一）
MUMmer 4 是一個(gè)快速比對 DNA 或蛋白序列的軟件，最常用的 program 就是 nucmer 和 promer，分別是比對核苷酸和氨基酸序列的，接下來以 nucm...
-
序列比對軟件 MUMmer 結(jié)果可讀化處理（四）
關(guān)于該軟件的計(jì)算可選參數(shù)以及結(jié)果文件的解讀，見前三篇分享： 序列比對軟件 MUMmer 快速上手（一）[http://www.itdecent.cn/writer#/not...
-
從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(四)
通常circos的中間部分不是空白區(qū)域，會用一條條線進(jìn)行連接，表示兩個(gè)染色體部分區(qū)域有關(guān)系。 數(shù)據(jù)格式 對于link，circos要求輸入數(shù)據(jù)至少有6列，分別是chr1 st...
-
從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(五)這一部分承接 從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(四)，對之前的布局進(jìn)行調(diào)整，使結(jié)構(gòu)更加適合于發(fā)表。 染色體的位置順序 默認(rèn)情況下是會顯示所有的染色體，而且會先從ath1到ath...
-
從零開始學(xué)CIRCOS繪制圈圖(二)在從零開始學(xué)Circos繪制圈圖（一）我們已經(jīng)繪制出一個(gè)比較丑的circos圖，這一部分是講解一些細(xì)節(jié)。 這一部分會從上一步的兩個(gè)文件開始，分別是 karyotype.tai...
-
基因 ID 和 Symbol 轉(zhuǎn)換前言 看了這么多期的 circos，都有點(diǎn)乏了，換換口味也是好的。 下面，咱就開始吧。 做生信分析，總是免不了要給基因 ID 和 Symbol 轉(zhuǎn)換來轉(zhuǎn)換去。 方法 一般要進(jìn)...
-
R語言之?dāng)?shù)據(jù)合并、拆分、去重
上下簡單合并 merge(df1, df2, all = T) dplyr的join系列合并數(shù)據(jù)框 library(tidyverse) —— 加載tidyverse包ful...
-
ImageJ拼接顯微鏡圖像拍照注意事項(xiàng) 首先圖像在拍的時(shí)候要保證： 不變倍鏡 不變焦 不改變曝光（手動曝光） 順序拍照 連續(xù)兩張照片之間保證至少1/2的圖像重疊 同一組圖像保存在同一個(gè)文件夾下 拼接圖...
-
【轉(zhuǎn)載】不確定性原理本質(zhì)上與量子力學(xué)無關(guān)，而是純數(shù)學(xué)現(xiàn)象很多人認(rèn)為，海森堡測不準(zhǔn)原理（不確定性原理）是關(guān)于觀察者通過光子與電子相互作用，從而影響光子的動量的理論。 觀察者必須影響電子的動量（或某些量子狀態(tài)）才能觀察到它，這可能是真...
-
生信 | circos文件準(zhǔn)備大全（以擬南芥為例）一、寫在前面 扣扣群：559758504（目前無需驗(yàn)證，一鍵即可加入） 如果你不想學(xué)，老板又催著要，你可以加群私聊我尋求幫助( $ _ $ )，但還是自己學(xué)，知識都是自己的。...
