發(fā)簡信
IP屬地：西藏
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互幫互助問答帖
雖然沒有幾個(gè)關(guān)注，但能看到這些筆記的應(yīng)該都是同志們 有時(shí)候朋友的私信我可能看不到，我也不一定能解決。 群體遺傳學(xué)方面、生信方面、R語言等等，如果...
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快速理解檢測(cè)基因流的f3和D統(tǒng)計(jì)量
1、D-statistic ABBA–BABA（也常寫成 D-statistic）是群體基因組學(xué)中用來檢測(cè)基因流（introgression）或...
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滑窗統(tǒng)計(jì)單位區(qū)間內(nèi)的XX數(shù)目
#!/usr/bin/perluse strict;use warnings;if(@ARGV != 3){ die "Usage: perl...
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CLUES 推斷位點(diǎn)的受選擇時(shí)間
CLUES（Conditional Likelihood Under Evolutionary Scenarios）是一個(gè)用于推斷單個(gè)位點(diǎn)在群體...
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Relate 估計(jì)位點(diǎn)的起源時(shí)間1、轉(zhuǎn)換文件格式 從 VCF 文件轉(zhuǎn)換為 relate 軟件可以讀取的 hap 格式： PATH_TO_RELATE/bin/RelateFil...
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VCF 文件格式轉(zhuǎn)換
推薦一個(gè) VCF 文件格式轉(zhuǎn)換的腳本。 https://github.com/edgardomortiz/vcf2phylip 常見用法：將 V...
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LDBlockShow 計(jì)算連鎖不平衡（LD）熱圖
安裝： wget https://github.com/hewm2008/LDBlockShow/archive/v1.40.tar.gztar...
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基于兩個(gè) fasta 序列獲得 vcf 文件
1. 基于 BWA 進(jìn)行序列比對(duì) bwa index reference.fastabwa mem reference.fasta sample...
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BAYENV2 計(jì)算位點(diǎn)的 XTX 值
Bayenv 是一種基于環(huán)境相關(guān)性識(shí)別與局部適應(yīng)相關(guān)位點(diǎn)的軟件，主要用于檢測(cè)那些在局部適應(yīng)過程中可能發(fā)揮重要作用的遺傳標(biāo)記（如 SNP）。 和環(huán)...