配色來源于論文 https://www.nature.com/articles/s41577-022-00707-2[https://www.nature.com/artic...
IP屬地：湖北
-
R語言ggplot2作圖好看的配色備選 -
如何下載TCGA數(shù)據(jù)/TCGA數(shù)據(jù)下載小教程1. 什么是TCGA？TCGA中有哪些數(shù)據(jù)？ TCGA的全稱是The Cancer Genome Atlas, 這個(gè)項(xiàng)目始于2005年，它旨在使用基因測序和生物信息學(xué)編目與癌...
-
3.2 GEO數(shù)據(jù)庫常用分析工具GEO數(shù)據(jù)庫常用分析工具 GEO DataSets提供的分析工具 GEO2R GEO DataSets提供的分析工具 在GEO DataSets的詳情界面有一個(gè)Data An...
-
GEO數(shù)據(jù)庫dataset和profiles區(qū)別GEO Database 近年來，利用高通量方法檢測基因表達(dá)越來越普及，諸如微陣列雜交和基因表系列分析（SAGE）可以同時(shí)測量數(shù)以萬計(jì)的基因轉(zhuǎn)錄腳本（gene transcr...
-
數(shù)據(jù)挖掘?qū)W習(xí)---GEO 數(shù)據(jù)庫簡介GEO 數(shù)據(jù)是生信技能樹生信爆款入門課程[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzAxMDkxODM1Ng==&mid=2247497973&i...
-
多芯片分析因?yàn)槟壳昂喜⒍鄠€(gè)測序、芯片數(shù)據(jù)集這一塊并沒有完全統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)，方法大概有五六種。公說公有理婆說婆有理，對(duì)于我這樣的新手來說，最簡單的是跟隨頂級(jí)文章的文章思路或者分析流程和步驟。...
-
生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級(jí)分析+多組學(xué)分析寫在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了，相關(guān)腳本、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時(shí)候感覺是浪費(fèi)時(shí)間，但是在寫的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到很多新的知識(shí)，不斷記錄反思，也...
-
學(xué)習(xí)筆記之巨噬細(xì)胞亞型功能分析
1、巨噬細(xì)胞 巨噬細(xì)胞（Macrophage, M）是一類位于外周血，炎癥組織中的白細(xì)胞。在動(dòng)物體內(nèi)主要通過吞噬細(xì)菌，死亡細(xì)胞及細(xì)胞殘片等作用參與非特異性免疫調(diào)節(jié)（先天性免疫...
-
復(fù)現(xiàn)3：AD外周血的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組與免疫組庫分析Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Immune Cell Signatures in Alzhei...
-
單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫
signatureDB - B cell數(shù)據(jù)庫CancerSEA - 癌癥單細(xì)胞KIT（腎臟單細(xì)胞數(shù)據(jù)庫）：http://humphreyslab.com/SingleCel...
-
轉(zhuǎn)錄組分析(1) - 基礎(chǔ)介紹轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)，廣義上指某一生理?xiàng)l件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合。轉(zhuǎn)...
-
單基因的腫瘤細(xì)胞系表達(dá)怎么看？CCLE告訴你泛癌的基因表達(dá)量一般可以用TCGA和GTEx實(shí)現(xiàn)，但是腫瘤細(xì)胞系一般用CCLE臨床生信之家[https://www.aclbi.com/static/index.html#/...
-
一文解決GEO芯片數(shù)據(jù)分析80％的工作！建議收藏！
你不得不知道的GEO數(shù)據(jù)庫芯片數(shù)據(jù)分析方法 大家好，我是阿琛。今天來給大家介紹一個(gè)新的專題內(nèi)容---GEO數(shù)據(jù)庫的使用方法。烹飪需要食材，分析需要數(shù)據(jù)。數(shù)據(jù)出發(fā)，整個(gè)研究的第...
-
低級(jí)膠質(zhì)瘤中EMILIN2的表達(dá)、甲基化和預(yù)后特征Wang LC, Cui WY, Zhang Z, Tan ZL, Lv QL, Chen SH, Shen XL. Expression, methylation and ...
-
ggplot2畫圖之優(yōu)化主題風(fēng)格（BBC---bbplot）最近在看文章圖片的時(shí)候，發(fā)現(xiàn)每張圖片的背景主題都非常的清爽，不像ggplot2的主題設(shè)置，后來在看一些文章時(shí)發(fā)現(xiàn)，發(fā)現(xiàn)很多人都在轉(zhuǎn)發(fā)《BBC視覺和數(shù)據(jù)新聞團(tuán)隊(duì)如何使用R繪制圖...