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    ENCODE ChIP-seq數(shù)據(jù) | 從下載到分析

    很久不見。錯過了很多的詢問和回復,很抱歉。這段時間在整理我的第一篇paper,大部分涉及的東西不太具有可分享性(其實也是應該記錄的)——————...

  • 環(huán)狀DNA (eccDNA)分析學習筆記

    最近在學習當下很火的環(huán)狀DNA(eccDNA)的建庫技術(shù)以及生信分析,特此記錄。 No.1 去低質(zhì)量&去接頭 這一步需要注意的是低質(zhì)量堿基的qu...

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    如何統(tǒng)計測序文件的reads長度分布

    記錄今天學會的一個小知識:統(tǒng)計測序文件的reads長度分布 由于某些原因,需要統(tǒng)計reads長度分布對建庫方法進行質(zhì)控,對測序數(shù)據(jù)進行可用與否的...

  • 單細胞測序分析學習筆記

    這一筆記的主要目的是記錄學習和實踐過程,所寫皆嘗試過為可用操作,看到的各位小伙伴有更好的操作歡迎隨時交流~ 1. 創(chuàng)建 R 4.0以上的con...

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    喜歡的音樂記錄

    發(fā)現(xiàn)年紀越大越容易不記得事情,以前記在本子上,收藏夾里的回憶都因為找不到本子、換了電腦而丟失,再想回去看看時,幾番尋找都再得不到。凡此過往,皆為...

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    科研實驗成功指南 | 低濃度質(zhì)粒真的包不好慢病毒嗎?

    今天要記錄一個很實用的實驗技巧:如題,怎么利用低濃度的質(zhì)粒包好慢病毒嗎? 慢病毒已經(jīng)成為目前生命科學領(lǐng)域一個很常用的進行基因表達調(diào)控的實驗方法了...

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    生信-單細胞分析 | scATAC分析踩坑記錄

    課題需要某一篇已發(fā)表文章的基于10x Genomics平臺的scATAC-seq數(shù)據(jù),于是乎,開始了踩坑指南。 No.1 數(shù)據(jù)下載 眾所周知,公...

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    Neuronscience | How to choose correct brain cell lines for your research

    今天這篇筆記主要是記錄一些查找的腦細胞系相關(guān)的資料。 接下來需要進行一些細胞系的實驗,因此在查找合適的已經(jīng)建好的能夠在體外培養(yǎng)的human br...

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    科研實用技能 | 運用軟件分析snp,indel等之后如何設(shè)計引物進行驗證呢

    最近在做一批樣本,是基于大規(guī)?;蚪M測序?qū)ふ倚碌募膊∠嚓P(guān)突變位點(snv)和indel等的。 軟件給出的結(jié)果一般都是以下形式,給出的只有突變所在...

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