發(fā)簡信
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bowtie2比對參考基因組（待續(xù)...）
準(zhǔn)備文件 物種A參考基因組，以及測序文件.fastq 測序文件質(zhì)控 這里用trim_galore，為什么用trim_galore，因?yàn)樗梢宰詣?dòng)...
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下載和更新R安裝R 選擇鏡像 選擇系統(tǒng) 點(diǎn)base，然后下載 更新R，最好在R gui里更新，用installr包來更新就行
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遇到command not found: shopt
遇到問題第一時(shí)間百度，發(fā)現(xiàn)是因?yàn)檠b了conda的原因，所以修改~/.bashrc中環(huán)境變量會(huì)出問題解決辦法如下： 配置完畢，解決問題
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安裝miniconda
首先去清華鏡像https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/找到最新版本然后 ...
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Linux筆記
筆記 在Windows中查看WSL的文件夾 解決Permission denied問題 sudo：是linux系統(tǒng)管理指令，是允許系統(tǒng)管理員讓普...
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用ClustalW進(jìn)行多序列比對，IQ-tree構(gòu)建進(jìn)化樹一、ClustalW進(jìn)行多序列比對 ClustalW是一種漸進(jìn)的比對方法，先將多個(gè)序列兩兩比對構(gòu)建距離矩陣，反映序列之間兩兩關(guān)系。然后根據(jù)距離矩...
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用TBtools做物種內(nèi)共線性分析（僅步驟）主要是參考https://www.tinymind.net.cn/articles/64d36abc7fd091 首先我們拿到的是以下的材料 1...
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biopython在pip以后import報(bào)錯(cuò)
背景：python版本3.7.4 用pip install biopython成功后，發(fā)現(xiàn)import Bio一直報(bào)錯(cuò)，最后經(jīng)過一番折騰，在ht...
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用python集合比較兩個(gè)基因名文件的差異
比較兩個(gè)基因名文件的差異 有時(shí)候需要比較兩個(gè)只有基因名的文件時(shí)，可以用將每個(gè)文件讀入，并用集合（set）的算法，來比較兩個(gè)文件 如： file1...