問題 安裝R包（seqinr）時遇到以下問題（缺少config文件）： 從報錯信息可以看出報錯根本原因是找不到zlib.h 問題解決： 1，確認(rèn)是否安裝zlib 注：上述命令...
發(fā)簡信
IP屬地：云南
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安裝R包 fatal error: zlib.h: No such file or directory 問題解決
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正則表達(dá)式手冊前言 正則在實際中太多時候用到了，但還沒有系統(tǒng)梳理過，這周學(xué)了一些正則參考實際經(jīng)常用到的寫一個簡單的手冊。 基礎(chǔ) 字符組 正則解釋[aA]字符組[] 允許匹配一組可能出現(xiàn)的字...
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生者為過客，死者為歸人–讀《誰在銀閃閃的地方，等你》在華人的世界里，大家都愿意歌頌生，卻忌諱談?wù)撍馈Ｉ窍Ｍ?，是延續(xù)，死是不可知的恐怖。 因為恐怖，所以焦慮。身體健康時，擔(dān)心會得病，得了病以后，擔(dān)心會死亡。我們急于逃離死亡的陰...
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TCGA|GEO可視化分析第1篇---相關(guān)性分析導(dǎo)讀：今天有小伙伴問我，篩選完差異基因后，想看自己關(guān)注的基因和其他基因的關(guān)系，應(yīng)該怎么做？那當(dāng)然要先做一下相關(guān)性分析了！好，下面讓我給大家娓娓道來...... 正文： ste...
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【R>>ggprism】Graphpad Prism繪圖風(fēng)格做科研的Graphpad Prism是避不開的一道關(guān)，那么是否可以用R來實現(xiàn)其繪圖風(fēng)格呢？在微信公眾號例竟然發(fā)現(xiàn)一篇好文，《一行代碼繪制Graphpad Prism風(fēng)格學(xué)術(shù)表...
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【R>>配對樣本】提取TCGA中的配對樣本
腫瘤研究中，常常需要關(guān)注癌和癌旁組織，這個時候就需要找出這些配對樣本。下面就來實戰(zhàn)吧！ 1.下載counts數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)為TPM counts轉(zhuǎn)TPM教程：【R>>IOBR】cou...
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【R>>DepMap】單基因腫瘤細(xì)胞表達(dá)情況CCLE是腫瘤細(xì)胞基因表達(dá)的百科全書，之前寫CCLE：求任意基因的相關(guān)性[http://www.itdecent.cn/p/59f979ab09ee]稍微介紹過其用法。今天...
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CCLE：求任意基因的相關(guān)性進(jìn)行腫瘤的研究，求兩個或多個基因的相關(guān)性，可以用GEPIA2或者直接下載數(shù)據(jù)用R語言處理，如果能再加上細(xì)胞系的相關(guān)性就能完美了。下面就分享下，手動下載CCLE測序數(shù)據(jù)，求任意...
