本次文章和大家討論一個大家可能胡遇到很常見的一個問題,在測序中我們很難避免引入一些微生物污染或者人類的污染,例如,我想測序擬南芥,其中由于實(shí)驗(yàn)員的操作不夠干凈,很容易引入一些...
本次文章和大家討論一個大家可能胡遇到很常見的一個問題,在測序中我們很難避免引入一些微生物污染或者人類的污染,例如,我想測序擬南芥,其中由于實(shí)驗(yàn)員的操作不夠干凈,很容易引入一些...
文章鏈接為:《Computational prediction and experimentalvalidation identify functionally conser...
在用R語言做數(shù)據(jù)處理時,通常使用的數(shù)據(jù)類型是數(shù)據(jù)框(可類比于excel表格,這樣腦海中會有一個直觀的印象)。那么數(shù)據(jù)清理過程中就會需要做各種變化和統(tǒng)計,比如按某些變量來分組并...
介紹這個軟件的概念前,我需要先解釋一個概念最近共同祖先時間(the time since the most recent common ancestor,TMRCA)。當(dāng)我們...
論文 https://www.nature.com/articles/s41559-022-01771-6#code-availability[https://www.nat...
不積跬步,無以至千里 本期我們嘗試復(fù)現(xiàn)2023年7月7日發(fā)表在Nature Communications上的Molecular profiling of aromatase ...
之前有過用二代測序的數(shù)據(jù)組裝植物葉綠體基因組昆蟲線粒體的經(jīng)歷,用的是單位的超算(Linux系統(tǒng))。 這里的二代測序數(shù)據(jù)是全基因組的淺層測序數(shù)據(jù),因?yàn)槿~綠體和線粒體是多拷貝的,...
最近在NAR上看到一篇文章: 原文網(wǎng)絡(luò)圖如下: 我們借此機(jī)會,通過ggraph作圖解析相關(guān)參數(shù)。詳細(xì)注釋代碼和參數(shù)已上傳QQ群文件!我做的圖如下,有一點(diǎn)問題,但不影響我們對這...
樣本構(gòu)成是實(shí)驗(yàn)的開端,也是后續(xù)分析的基礎(chǔ),所以樣本信息在論文中需要詳細(xì)展示,涉及到你實(shí)驗(yàn)的真實(shí)性和可重復(fù)性。一般樣本構(gòu)成可以使用AI做示例圖,有些臨床采樣,可以使用柱狀體的方...