Maybe growing up isn't learning how to work harder -- it's learning how to not let work...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：英格蘭
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It's funny to worry about going to work
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Markdown數(shù)學(xué)公式語(yǔ)法
一、簡(jiǎn)單分類 1. 行內(nèi)公式 將公式插入到本行內(nèi)，符號(hào)：$公式內(nèi)容$，如：$xyz$ 2. 行間公式 將公式插入到新的一行內(nèi)，并且居中，符號(hào)：$公式內(nèi)容$，如：$$xyz$$...
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vim中文輸入亂碼的問(wèn)題解決
在用vim寫(xiě)腳本時(shí)，有時(shí)注釋的時(shí)候想用中文，這樣方便理解閱讀。但在輸入中文時(shí)，會(huì)出現(xiàn)亂碼。需要修改一下vim的配置文件。 保存退出。
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K-mer分析獨(dú)立實(shí)驗(yàn) 將某隨機(jī)試驗(yàn)重復(fù)N次，若各次試驗(yàn)結(jié)果互不影響，即每次試驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)的概率都不依耐于其他各次試驗(yàn)的結(jié)果，則稱這N次試驗(yàn)是獨(dú)立的。 貝努利試驗(yàn)（Bernoulli tri...
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轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)戰(zhàn)第一天就踩的坑——sed與換行符的恩怨
題目是這樣的： 統(tǒng)計(jì)SRR1039510_1.fastq.gz堿基總數(shù) 1575000 由于上一題已經(jīng)列出了該文件中所有的序列 于是我想，這還不簡(jiǎn)單，直接wc -c 但是，...
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【生信技能樹(shù)培訓(xùn)】R語(yǔ)言中文件的讀取文件讀取 一、csv格式文件的打開(kāi) 用Excel打開(kāi) 用記事本打開(kāi)，打開(kāi)后顯示逗號(hào)分割每一列 sublime打開(kāi)（適用于大文件） csv的本質(zhì)是純文本文件。 R語(yǔ)言中讀取CS...
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【生信技能樹(shù)培訓(xùn)】R語(yǔ)言基礎(chǔ)【20230112更新】本培訓(xùn)使用R 4.2及以上版本。 一、前言 用R分析數(shù)據(jù)得出結(jié)果，需要解決兩個(gè)問(wèn)題： 用什么包/函數(shù)來(lái)處理數(shù)據(jù)？如何整理數(shù)據(jù)，使得數(shù)據(jù)可以套進(jìn)函數(shù)里進(jìn)行處理？ （一）在R中新...
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給BAM文件建立索引：用于可視化
當(dāng)進(jìn)行完比對(duì)后，有時(shí)想要在IGV里面直觀的查看比對(duì)的結(jié)果，這時(shí)候就需要在IGV里面加載BAM文件。同參考序列一樣，BAM文件在IGV里面進(jìn)行加載前需要?jiǎng)?chuàng)建索引?？梢酝ㄟ^(guò)兩種方...
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努力努力再努力~<br>個(gè)人博客：<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Flishensuo.github.io%2F" target="_blank">https://lishensuo.github.io/</a>
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生物信息；python/R/Shell編程學(xué)習(xí)~<br>生信博士在讀~ wx同號(hào)～
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個(gè)性化生信分析
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給FASTA文件建立索引2：用于比對(duì)
進(jìn)行序列比對(duì)之前，需要首先對(duì)參考基因組序列建立索引，這樣使程序在運(yùn)行時(shí)能更高效的進(jìn)行比對(duì)。用bwa工具舉例（假設(shè)用于比對(duì)的參考基因組序列文件為AF086833.fa）： 每個(gè)...
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vim中批量刪除包含某一字符串的行
情況：在下載的樣本信息文本中，有些值是missing，于是想把這些值都刪去。 方法：在vim中的命令模式輸入 另存為samples_withoutmissing.txt，并退出。
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根據(jù)項(xiàng)目編號(hào)從NCBI上下載樣本信息
發(fā)表的文章，如果其數(shù)據(jù)儲(chǔ)存在NCBI上，那么應(yīng)該會(huì)在文章中告訴NCBI上的項(xiàng)目編號(hào)，我們可以據(jù)此下載這篇文章涉及的原始測(cè)序數(shù)據(jù)，樣本信息，蛋白序列等信息，只要是作者上傳在了N...
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IGV的安裝與使用
什么是IGV？ IGV=Integrated Genomics Viewer, 即序列比對(duì)的可視化呈現(xiàn)的一個(gè)軟件。參考序列可以導(dǎo)入文件，也可以在線搜索相應(yīng)的基因組數(shù)據(jù)，然后將...
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不再更新
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給FASTA文件建立索引1：用于查找
給FASTA文件建立索引的目的是為了更快速的訪問(wèn)序列文件的某一特定的內(nèi)容。比如，可以通過(guò)指定基因組中的具體某個(gè)染色體上的某段位置，來(lái)找到其對(duì)應(yīng)的序列。 實(shí)現(xiàn)方法是通過(guò)samt...
