今天這個(gè)小tip還挺實(shí)用的我早上正在使用筆記本電腦上網(wǎng)，突然往斷了，各種wifi 都連接不上去，然后設(shè)置了網(wǎng)絡(luò)reset之后，更加連信號(hào)都搜不到了。 這要是在開會(huì)或者有正事，...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：浙江
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2021-11-10 windos10 系統(tǒng)無線上網(wǎng)功能突然消失，wifi搜不到任何信號(hào)源 （AX201 160MHz）
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看你的需求，群體水平質(zhì)控最好一起吧
2018-11-01GWAS實(shí)戰(zhàn)（四）plink 進(jìn)階之?dāng)?shù)據(jù)過濾
數(shù)據(jù)好不好，影響到結(jié)果的準(zhǔn)確性，所以我們要來對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾，過濾前，我們應(yīng)該對(duì)數(shù)據(jù)的部分特征進(jìn)行統(tǒng)計(jì)描述，以此為依據(jù)來進(jìn)行過濾。 這里介紹的幾個(gè)指標(biāo)：1.individual...
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您好！請(qǐng)問做質(zhì)控是否一定要將個(gè)體的所有染色體數(shù)據(jù)bmerge到一個(gè)文件才能開始？因?yàn)槲业臄?shù)據(jù)太大了，磁盤放不下，所以想分批過濾可以逐步減少文件內(nèi)存。
感謝你的回答！ -
微信公眾號(hào)番茄隨筆
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2021-06-30 一些概念的記錄
最小等位基因頻率和為什么要過濾 最小等位基因頻率怎么計(jì)算？比如一個(gè)位點(diǎn)有AA或者AT或者TT，那么就可以計(jì)算A的基因頻率和T的基因頻率，qA + qT = 1，這里誰比較小，...
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2021-06-11 EigenGWAS 用在哪里比較好
最近真的有點(diǎn)倒霉，骨折了，已經(jīng)躺了好多天，所有的事情都暫停了下來。 可能這就是命運(yùn)吧，讓我老老實(shí)實(shí)呆在家中，哪里也去不了。 北京之行也直接中斷了，好在已經(jīng)把EigenGWAS...
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2021-05-28 EigenGWAS 使用排雷記錄（非正式）
這幾天一直在上海 北京交流，和很多實(shí)驗(yàn)室的老師同學(xué)一起討論問題，感覺學(xué)到了非常多的知識(shí)。 雖然EigenGWAS 已經(jīng)基本成型，在線網(wǎng)站 www.eigengwas.com[...
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2021-01-06利用Aspera從ENA上下載SNP數(shù)據(jù)1.Linux服務(wù)器安裝Aspera Note:如果服務(wù)器無法用其中一個(gè)版本的Aspera，建議更換Aspera的版本。參考:http://www.itdecent.cn/...
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2021-01-15 基因組注釋文件gff3轉(zhuǎn) gtf格式
這個(gè)其實(shí)在服務(wù)器聯(lián)網(wǎng)的狀態(tài)下，操作起來十分簡(jiǎn)單 首先給服務(wù)器安裝conda 然后用conda安裝gffread 安裝好之后，一條命令搞定 反過來也可以 如果沒有l(wèi)inux系統(tǒng)...
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2021-01-04 IQ-TREE2 快速構(gòu)建進(jìn)化樹不知不覺又過了一年，人總是容易懈怠和疲倦，但是每次想起來，還是之前認(rèn)認(rèn)真真學(xué)習(xí)記錄的時(shí)候最踏實(shí)。今天記錄一下IQ TREE的使用 其實(shí)IQtree的網(wǎng)站做的很好，很方便學(xué)習(xí)：...
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2020-12-16 解決一個(gè)基因矯正的問題問題描述：有些物種，基因組拼接的可能不是很好，或者說，在基因注釋的時(shí)候，沒有注釋的很清楚，這個(gè)時(shí)候會(huì)懷疑直接從基因組fasta文件和gff3文件中提取的基因是有問題的，那么如...
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2020-12-10服務(wù)器管理
1.用戶管理 2.權(quán)限管理 3.磁盤管理 4.進(jìn)程管理 5.服務(wù)器安全 問題描述：Linux個(gè)人賬戶由于密碼設(shè)的過于簡(jiǎn)單導(dǎo)致被人入侵。個(gè)人賬號(hào)一提交命令就被kill掉參考:h...
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簡(jiǎn)潔 | 優(yōu)雅地整理 BLAST 比對(duì)結(jié)果寫在前面 用過 BLAST 進(jìn)行基因功能注釋的朋友應(yīng)該常常遇到兩個(gè)問題： BLAST 輸出格式較多，選擇哪一類輸出格式更為實(shí)用？ 輸出結(jié)果信息較多，如果方便下游數(shù)據(jù)分析？ B...
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2020-11-18gffcompare學(xué)習(xí)1.gffcompare軟件介紹 當(dāng)與參考注釋文件進(jìn)行比較時(shí)，gffcompare可用于比較、合并、注釋和估計(jì)一個(gè)或多個(gè)GFF文件的準(zhǔn)確性。 2.gffcompare軟件使用...
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生信初學(xué)者--小瑜
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2020-09-23 windows電腦使用MEGA_X_10.1.18快速畫一個(gè)進(jìn)化樹對(duì)于畫進(jìn)化樹，其實(shí)有很多的軟件和方法，有命令行的，也有可視化界面的，還有在線網(wǎng)站（iTol）這樣在線美化的，但是對(duì)于生信小白來說，最重要的是先上手，這里簡(jiǎn)單記錄一下，最快速度...
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這個(gè)沒有特定的，你根據(jù)自己的需要設(shè)置就行
2018-11-05 GWAS實(shí)戰(zhàn)（六）plink 進(jìn)階之主成分分析和群體分層
要學(xué)習(xí)這一節(jié)，首先是要學(xué)習(xí)什么是主成分，什么是聚類這個(gè)我一直有點(diǎn)搞混，可以百度谷歌查一查http://www.cnblogs.com/pinard/p/6239403.htm...
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2020-07-26 理清深度學(xué)習(xí)中的三個(gè)概念 Epoch Batch Iteration
在最初學(xué)習(xí)深度學(xué)習(xí)的時(shí)候,比較容易混淆三個(gè)概念Epoch Batch Iteration如果對(duì)這三個(gè)概念沒有一個(gè)清晰的認(rèn)識(shí)的話, 在看別人文章的時(shí)候,很容易犯糊涂 Epoch...
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2020-04-06 Linux 命令學(xué)習(xí) - 查看CPU、內(nèi)存和硬盤信息一般來說，拿到計(jì)算機(jī)以后，需要先看一下電腦的配置，這里主要學(xué)習(xí)一下看CPU的信息和內(nèi)存的使用情況： CPU 首先要了解 CPU的一些基礎(chǔ)知識(shí)百度百科里面都有 CPU的基礎(chǔ)...
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2020-01-31 RNA-seq 鏈特異性文庫 lncRNA 理解本次主要來理解一下什么是鏈特異性文庫，為什么要構(gòu)建這種文庫。 首先要明確幾個(gè)概念，對(duì)理解后面的講解很有幫助： 基本概念 正鏈（forward strand）: 我們可以理解為...
