今天這個(gè)小tip還挺實(shí)用的我早上正在使用筆記本電腦上網(wǎng),突然往斷了,各種wifi 都連接不上去,然后設(shè)置了網(wǎng)絡(luò)reset之后,更加連信號(hào)都搜不到了。 這要是在開會(huì)或者有正事,...
今天這個(gè)小tip還挺實(shí)用的我早上正在使用筆記本電腦上網(wǎng),突然往斷了,各種wifi 都連接不上去,然后設(shè)置了網(wǎng)絡(luò)reset之后,更加連信號(hào)都搜不到了。 這要是在開會(huì)或者有正事,...
看你的需求,群體水平質(zhì)控最好一起吧
2018-11-01GWAS實(shí)戰(zhàn)(四)plink 進(jìn)階之?dāng)?shù)據(jù)過濾數(shù)據(jù)好不好,影響到結(jié)果的準(zhǔn)確性,所以我們要來對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾,過濾前,我們應(yīng)該對(duì)數(shù)據(jù)的部分特征進(jìn)行統(tǒng)計(jì)描述,以此為依據(jù)來進(jìn)行過濾。 這里介紹的幾個(gè)指標(biāo):1.individual...
您好!請(qǐng)問做質(zhì)控是否一定要將個(gè)體的所有染色體數(shù)據(jù)bmerge到一個(gè)文件才能開始?因?yàn)槲业臄?shù)據(jù)太大了,磁盤放不下,所以想分批過濾可以逐步減少文件內(nèi)存。
感謝你的回答!
最小等位基因頻率和為什么要過濾 最小等位基因頻率怎么計(jì)算?比如一個(gè)位點(diǎn)有AA或者AT或者TT,那么就可以計(jì)算A的基因頻率和T的基因頻率,qA + qT = 1,這里誰比較小,...
最近真的有點(diǎn)倒霉,骨折了,已經(jīng)躺了好多天,所有的事情都暫停了下來。 可能這就是命運(yùn)吧,讓我老老實(shí)實(shí)呆在家中,哪里也去不了。 北京之行也直接中斷了,好在已經(jīng)把EigenGWAS...
這幾天一直在上海 北京交流,和很多實(shí)驗(yàn)室的老師同學(xué)一起討論問題,感覺學(xué)到了非常多的知識(shí)。 雖然EigenGWAS 已經(jīng)基本成型,在線網(wǎng)站 www.eigengwas.com[...
1.Linux服務(wù)器安裝Aspera Note:如果服務(wù)器無法用其中一個(gè)版本的Aspera,建議更換Aspera的版本。參考:http://www.itdecent.cn/...
這個(gè)其實(shí)在服務(wù)器聯(lián)網(wǎng)的狀態(tài)下,操作起來十分簡(jiǎn)單 首先給服務(wù)器安裝conda 然后用conda安裝gffread 安裝好之后,一條命令搞定 反過來也可以 如果沒有l(wèi)inux系統(tǒng)...
不知不覺又過了一年,人總是容易懈怠和疲倦,但是每次想起來,還是之前認(rèn)認(rèn)真真學(xué)習(xí)記錄的時(shí)候最踏實(shí)。今天記錄一下IQ TREE的使用 其實(shí)IQtree的網(wǎng)站做的很好,很方便學(xué)習(xí):...
問題描述:有些物種,基因組拼接的可能不是很好,或者說,在基因注釋的時(shí)候,沒有注釋的很清楚,這個(gè)時(shí)候會(huì)懷疑直接從基因組fasta文件和gff3文件中提取的基因是有問題的,那么如...
1.用戶管理 2.權(quán)限管理 3.磁盤管理 4.進(jìn)程管理 5.服務(wù)器安全 問題描述:Linux個(gè)人賬戶由于密碼設(shè)的過于簡(jiǎn)單導(dǎo)致被人入侵。個(gè)人賬號(hào)一提交命令就被kill掉參考:h...
寫在前面 用過 BLAST 進(jìn)行基因功能注釋的朋友應(yīng)該常常遇到兩個(gè)問題: BLAST 輸出格式較多,選擇哪一類輸出格式更為實(shí)用? 輸出結(jié)果信息較多,如果方便下游數(shù)據(jù)分析? B...
1.gffcompare軟件介紹 當(dāng)與參考注釋文件進(jìn)行比較時(shí),gffcompare可用于比較、合并、注釋和估計(jì)一個(gè)或多個(gè)GFF文件的準(zhǔn)確性。 2.gffcompare軟件使用...
對(duì)于畫進(jìn)化樹,其實(shí)有很多的軟件和方法,有命令行的,也有可視化界面的,還有在線網(wǎng)站(iTol)這樣在線美化的,但是對(duì)于生信小白來說,最重要的是先上手,這里簡(jiǎn)單記錄一下,最快速度...
這個(gè)沒有特定的,你根據(jù)自己的需要設(shè)置就行
2018-11-05 GWAS實(shí)戰(zhàn)(六)plink 進(jìn)階之主成分分析和群體分層要學(xué)習(xí)這一節(jié),首先是要學(xué)習(xí)什么是主成分,什么是聚類這個(gè)我一直有點(diǎn)搞混,可以百度谷歌查一查http://www.cnblogs.com/pinard/p/6239403.htm...
在最初學(xué)習(xí)深度學(xué)習(xí)的時(shí)候,比較容易混淆三個(gè)概念Epoch Batch Iteration如果對(duì)這三個(gè)概念沒有一個(gè)清晰的認(rèn)識(shí)的話, 在看別人文章的時(shí)候,很容易犯糊涂 Epoch...
一般來說,拿到計(jì)算機(jī)以后,需要先看一下電腦的配置,這里主要學(xué)習(xí)一下看CPU的信息和內(nèi)存的使用情況: CPU 首先要了解 CPU的一些基礎(chǔ)知識(shí)百度百科里面都有 CPU的基礎(chǔ)...
本次主要來理解一下什么是鏈特異性文庫,為什么要構(gòu)建這種文庫。 首先要明確幾個(gè)概念,對(duì)理解后面的講解很有幫助: 基本概念 正鏈(forward strand): 我們可以理解為...