如何使用 AutoDock Vina 準(zhǔn)備受體（Receptor Preparation）通常是從 PDB 數(shù)據(jù)庫下載蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。alphafold db[https://a...
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AutoDock Vina 筆記 -
筆記：神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)中的“訓(xùn)練”+PyTorch構(gòu)建簡單的二分類模型一、訓(xùn)練（Training） 流程概覽：數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 → 前向傳播 → 損失計算 → 反向傳播 → 優(yōu)化器更新參數(shù) → 下一批次數(shù)據(jù) → 循環(huán)多次直到模型收斂或達(dá)到最大 Epoc...
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PyTorch - 1. 張量（Tensor）
什么是 PyTorch 張量？ PyTorch 中的張量（Tensor）是一個可以在 GPU 或 CPU 上進(jìn)行高效計算的多維數(shù)組，類似于 NumPy 的 ndarray，但...
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服務(wù)器數(shù)據(jù)上傳huggingface
1. Python上傳 1. 安裝（如果還沒裝）： 2. 登錄 Hugging Face： 在：https://huggingface.co/settings/tokens[...
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SRAgent： 自動搜索 + 標(biāo)準(zhǔn)化注釋 SRA 數(shù)據(jù)中的 10X sv RNA-seq 項目
?? 項目概覽 SRAgent 自動化地搜索、提取并注釋 10X Genomics 單細(xì)胞 RNA?seq 數(shù)據(jù)，是構(gòu)建 scBaseCamp 的關(guān)鍵基礎(chǔ)設(shè)施之一 scBase...
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Miniforge 安裝（保留原有miniconda）'https://github.com/conda-forge/miniforge'[https://github.com/conda-forge/miniforge'] h...
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入門用戶配置 PyTorch GPU 環(huán)境
0. 檢查 GPU 狀態(tài)（顯卡是否激活） 任務(wù)管理器-性能-GPU 正確顯示型號就是顯卡激活 GPU型號是否支持 CUDA當(dāng)前狀態(tài)0Intel UHD Graphics 6...
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PyTorch 簡介
一、什么是 PyTorch？ PyTorch 是一個由 Facebook（現(xiàn) Meta）人工智能研究院（FAIR）于 2016 年發(fā)布的 開源深度學(xué)習(xí)框架，基于 Python...
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深度學(xué)習(xí)
1. 什么是深度學(xué)習(xí)? 深度學(xué)習(xí)是機(jī)器學(xué)習(xí)（Machine Learning）的一個重要分支，其核心是多層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（Deep Neural Networks）。它擅長從大量數(shù)...
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GPU（Graphics Processing Unit）
什么是GPU？ GPU（Graphics Processing Unit），即圖形處理單元，最初設(shè)計用于加速計算機(jī)圖形和圖像渲染。 現(xiàn)代GPU不僅用于圖形處理，也廣泛應(yīng)用于科...
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scbasecount?? Intro 公共數(shù)據(jù)庫（SRA）的10x數(shù)據(jù)統(tǒng)一處理 大規(guī)模統(tǒng)一數(shù)據(jù)倉庫scBaseCount（又稱 scBaseCamp）由 Arc?Institute 等機(jī)構(gòu)開發(fā)，目...
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Chromap output 理解Understanding The Chromap Summary File[https://notarocketscientist.xyz/posts/2024-07-23...
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量化免疫浸潤時CIBERSORT的注意事項CIBERSORT的注意事項 CIBERSORT的使用，我們舉了幾個例子，但是還有一些疑問，只要有疑問在，就感覺心里不踏實。比如：1.CIBERSORT需要什么樣的數(shù)據(jù)？是芯...
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生信地基系列--Sam/bam文件格式對于sam文件格式，已經(jīng)有很多人寫過相應(yīng)的中文介紹文章，但是基本上都是簡單粗暴的講了一下每個字符代表什么，但是如果真去研究的話有時候還是感覺有點這些寫的還是讓人懵逼，比如不知...
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monocle2 安裝 記錄
【倒霉bug】24/02/26_不存在叫‘qlcmatrix’這個名字的程輯包-CSDN博客[https://blog.csdn.net/weixin_51120349/ar...
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GDAS002-Bioconductor備忘錄
title: GDAS002-Bioconductor備忘錄date: 2019-09-02 12:0:00type: "tags"tags: Bioconductorcat...
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scTCR-seq分析: MIXCR + scRepertoire
https://www.borch.dev/uploads/screpertoire/[https://www.borch.dev/uploads/screpertoire/]
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TCR-seq 分析 {MiXCR}MiXCR GitHub - milaboratory/mixcr: MiXCR is an ultimate software platform for analysis ...
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Metaneighbor - 探究不同研究中的細(xì)胞亞類的相關(guān)性MetaNeighbor/Documentation.md at master · gillislab/MetaNeighbor · GitHub[https://githu...