發(fā)簡信
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一對多數(shù)據(jù)的互換我們的目的是要將以下格式的數(shù)據(jù)相互轉(zhuǎn)換。 暫時沒有找到一部到位的方法，只能使用較為繁瑣的方法進行轉(zhuǎn)換。 1 對數(shù)據(jù)進行長數(shù)據(jù)化 2. 拷貝到ex...
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修改SRA已上傳的數(shù)據(jù)信息已上傳SRA的數(shù)據(jù)信息，可以登錄后通過數(shù)據(jù)修改頁面進行修改。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/docs/subm...
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edgeR的簡單實用流程前些天，實驗室里的同事，為了補充計算幾個比較組合的差異分析，花了幾千元，真夠冤枉的。但礙于我們實驗室對生信技術(shù)的鄙夷，我也懶得理睬。這里簡單介紹...
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非參數(shù)檢驗-計算部分
非參數(shù)檢驗，一般是在分布未知的情況下使用。我們首先會先對數(shù)據(jù)進行正態(tài)檢驗和方差齊性分析，如果均不服從，則對數(shù)據(jù)進行變化，如果還是不服從，則進行非...
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R中read.table()漏行的問題
read.table()和read.delim()是我們常用的表格讀入命令。但有時候會出現(xiàn)讀漏行的情況。 原本4274的數(shù)據(jù)，讀取后只有3829...
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R安裝包報錯-“had non-zero exit status”在使用remotes::install_github安裝包的時候，出現(xiàn)“ had non-zero exit status”的報錯。 提示已經(jīng)下...
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用R提取非表格的特定行有時候我們需要提取非表格文件中含有某些符號的特定的行，例如，我們需要從下面fasta文件中提取所有包含">"的行， 基本思路是逐行讀入，定位，按...
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TopGO出圖的簡易方法GO富集出來的結(jié)果可以非常多，如果沒有一個層級顯示，將會非常眼花繚亂。TopGO則通過DAG（Directed acyclic graph）解決...
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兩列data frame轉(zhuǎn)換成帶行名的vector
從兩列的數(shù)據(jù)框轉(zhuǎn)變成第一列為行名的向量，兩列數(shù)據(jù)讀入，如下： 要轉(zhuǎn)變成如下向量： 具體思路是先轉(zhuǎn)變成矩陣，設(shè)定行名，提取數(shù)據(jù)，最后轉(zhuǎn)變成向量。設(shè)...