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sam和bam格式文件的shell小練習
先使用bowtie2軟件自帶的測試數(shù)據生成sam/bam文件，代碼如下： 1.統(tǒng)計共多少條reads(pair-end reads這里算一條)參與了比對參考基因組 2.統(tǒng)計共...
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fasta和fastq格式文件的shell小練習這個是有機結合生物信息學的linux和數(shù)據格式的練習題： 下載bowtie2軟件后拿到示例數(shù)據： 1.統(tǒng)計reads_1.fq 文件中共有多少條序列信息 2.輸出所有的rea...
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【linxu編程】Linux文本處理三劍客——sed
sed 是一種流編輯器，它一次處理一行內容。 處理時，把當前處理的行存儲在稱為“模式空間”（pattern space）的臨時緩沖區(qū)中，接著用 sed 命令處理緩沖區(qū)中的內容...
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前言科學-3D2Y<br><br>簡書博客<br><a href="http://www.itdecent.cn/u/599a9e91afc8" rel="nofollow" target="_blank">http://www.itdecent.cn/u/599a9e91afc8</a><br><br>CSDN博客<br><a href="https://blog.csdn.net/leadingsci" rel="nofollow" target="_blank">https://blog.csdn.net/leadingsci</a><br><br>微店：<br><a href="https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile" rel="nofollow" target="_blank">https://weidian.com/?userid=583316993&wfr=wx_profile</a>
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linux20道練習題1.在任意文件夾下面創(chuàng)建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夾系列。 2.在創(chuàng)建好的文件夾下面，比如我是/Users/jimmy/tmp/1/2/3/4/5/...
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GEO數(shù)據挖掘實例
2019.08.22 今天學習了r語言關于GEO數(shù)據挖掘方面的知識點，做一些整理。 1.首先是相應數(shù)據的下載與檢查 利用R包進行下載 2.構建矩陣，數(shù)據處理（DEG） 3.進...
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作業(yè)在：RNA-seq小考核 | 生信菜鳥團，鏈接是 http://www.bio-info-trainee.com/3920.html 任務量有點重，歡迎大家在提交作業(yè)的同時寫一下自己的心得體會，踩坑記錄等等
