分開(kāi)與合在一起都可以分析,但目的不同。 分開(kāi)分析更多強(qiáng)調(diào)看通路是被激活還是被抑制; 合在一起分析更宏觀。 1 為什么要分開(kāi)討論?因?yàn)槲覀兿Mㄟ^(guò)看顯著上調(diào)或下調(diào)的基因中通過(guò)G...
分開(kāi)與合在一起都可以分析,但目的不同。 分開(kāi)分析更多強(qiáng)調(diào)看通路是被激活還是被抑制; 合在一起分析更宏觀。 1 為什么要分開(kāi)討論?因?yàn)槲覀兿Mㄟ^(guò)看顯著上調(diào)或下調(diào)的基因中通過(guò)G...
年底復(fù)盤,發(fā)現(xiàn)很多知識(shí)點(diǎn)理解并不深入,想對(duì)這些不清晰的知識(shí)點(diǎn)重新梳理一下。 一、NormalizeData()歸一化 考慮到文庫(kù)測(cè)序深度的影響,我們需要對(duì)單細(xì)胞counts矩...
NMF算法簡(jiǎn)介 非負(fù)矩陣分解(Non-negative Matrix Factorization, NMF)的思想可以描述為,對(duì)于任意給定的一個(gè)非負(fù)矩陣V,NMF算法能夠找到...
在R語(yǔ)言中,set.seed函數(shù)是一個(gè)重要的工具,它用于設(shè)置隨機(jī)數(shù)生成器的種子。種子是隨機(jī)數(shù)生成過(guò)程中的起始點(diǎn),它決定了隨機(jī)數(shù)序列的起始值。通過(guò)設(shè)置相同的種子,我們可以確保每...
醫(yī)學(xué)生零基礎(chǔ)學(xué)生信是先學(xué)Python還是先學(xué)R語(yǔ)言?[https://www.zhihu.com/question/432353982]如何學(xué)習(xí)R語(yǔ)言[https://www...
STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開(kāi), https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
title:scenic: single-cell regulatory network inference and clustering journal:Nature me...
GEO數(shù)據(jù)挖掘或轉(zhuǎn)錄組分析差異表達(dá)[https://www.plob.org/tag/%e5%b7%ae%e5%bc%82%e8%a1%a8%e8%be%be]基因時(shí),結(jié)果中...
文章接受,終于有空再發(fā)點(diǎn)筆記了?? SCENIC_Tutorial[#scenic_tutorial]Setup[#setup]Load Packages[#load-pack...