發(fā)簡(jiǎn)信
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AlphaFold 3-PyMOL可視化1. 軟件安裝 AlphaFold 3分析網(wǎng)站(需要梯子和谷歌賬號(hào))：https://golgi.sandbox.google.com/abou...
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GFF文件轉(zhuǎn)換Genbank文件及Mauve多序列比對(duì)前言 有很多軟件都可以完成gff文件到genbank文件的轉(zhuǎn)換，如腳本：https://github.com/chundruv/GFF-to-G...
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主成分分析（PCA）& 主坐標(biāo)分析（PCoA）——R包繪圖（2D/3D散點(diǎn)圖）導(dǎo)讀 主成分分析(Principal Components Analysis，PCA)，也稱主分量分析或主成分回歸分析法，是一種無(wú)監(jiān)督的數(shù)據(jù)降維...
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GO/KEGG富集分析及R包繪圖（氣泡圖/條形圖）導(dǎo)讀 利用富集分析，我們可以把很多看著雜亂的差異基因總結(jié)出一個(gè)比較整體反應(yīng)事件發(fā)生的概述性的句子。 例如：TP53信號(hào)通路和胃癌的發(fā)生有關(guān)。而不...
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16s—β多樣性分析（R畫三維PCoA圖）一、β多樣性分析的概念 Beta多樣性指的是樣本間多樣性。在腸道菌群分析中，Beta多樣性是衡量個(gè)體間微生物組成相似性的一個(gè)指標(biāo)。通過計(jì)算樣本間...
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16s—α多樣性分析（R畫箱線圖）一、α多樣性分析的概念 α多樣性分析是反映生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)物種的多樣性，包括豐富度和均勻度的綜合指標(biāo)。 豐富度：物種類別的多少，越豐富多樣性越高。 均...