基因組組裝 1.k-mer 那么我們首先要看一下k-mer是什么。它的定義是：是指將一條序列分成包含k個堿基的子字符串，如果reads長度為L，k-mer長度設(shè)為k，則產(chǎn)生的...
發(fā)簡信
IP屬地：臺灣
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基因組組裝和注釋理論 -
TBtools - 超過一萬人在使用的生信小工具寫在前面 TBtools 命令行接口一直保留著我開始開發(fā) TBtools 的時(shí)間。至今已有五年，也迭代了 至少150個的版本，累計(jì)不少于10000用戶 。TBtools 與用...
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使用misa查找ssr位點(diǎn)1. 下載基因組文件，ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCA/002/864/125/GCA_002864125.1_ASM28...
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小麥misa+primer3設(shè)計(jì)SSR引物,并用e-PCR進(jìn)行篩選1. 軟件下載并安裝 #下載misa軟件 #下載配置文件 #下載3個perl腳本 # 搜索并安裝primer3 #下載e-PCR并安裝 2. 分析SSR 準(zhǔn)備要提取的序列的...
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misa和primer3結(jié)合快速設(shè)計(jì)SSR引物
文件下載 下載misa，同時(shí)將misa.ini放在misa的同一個文件夾下，然后下載三個perl腳本get_set_trimmer.pl、p3_in.pl和p3_out.pl...
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微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小結(jié)：從OTU table到marker物種筆記內(nèi)容：由二代測序產(chǎn)生的序列數(shù)據(jù)（.fastq）到OTU table， 距離矩陣，物種多樣性指數(shù)，序列的進(jìn)化樹及物種注釋信息的可分析數(shù)據(jù)，為常規(guī)分析流程?？梢允褂胾sear...
