有時候不得不感慨,時間已經(jīng)來到了2024年的尾聲,但是對于許多非模式的物種來說,各種工具、數(shù)據(jù)集、參考等等依然還在寒冬。今天帶大家手動的構建屬于...
近日10X終于發(fā)布了他們擁有亞細胞分辨率的空間轉錄組產(chǎn)品,并給出了一些列的測試數(shù)據(jù)。今天帶大家進行一些基本的探索與實戰(zhàn) 1 數(shù)據(jù)下載 這里筆者選...
隨著空間轉錄組技術的普及,越來越多的課題開始使用這一技術。當前,以10X Visium為代表的空間轉錄組技術是目前最常見的技術。然而,10X V...
隨著單細胞技術的發(fā)展和普及,越來越多的課題組開始使用單細胞技術進行自己的課題研究。然而,在單細胞的注釋上,商業(yè)公司提供的流程化注釋往往難以滿足實...
目前,隨著測序成本的降低,越來越多的WGS/WES項目開始普及,也更多的課題組擁有自己的服務器,但是大數(shù)據(jù)帶來的計算緩慢問題也越發(fā)凸顯。這里和大...
相信學習生信的小伙伴不難發(fā)現(xiàn),在定量的時候大多的文章或者公司的結果都有這幾種定量的方式:FPKM(RPKM),TPM,CPM(RPM)還有cou...
REACTOME 是一個開源、放開、人工整理并經(jīng)過同行評審的通路數(shù)據(jù)庫。目標是為各個通路提供可視化、可解釋的分析,以支持基礎研究、臨床研究、基因...
傳統(tǒng)轉錄組的分析想必大家已經(jīng)非常熟悉,無非是質控 -> 比對 -> 組裝 ->定量 -> 差異分析 -> 差異表達基因功能富集分析這個套路。目前...
蘋果的m1芯片已經(jīng)出到了第二代的m1pro/max版本了,不少同學也是用上了新的macbook,m1芯片的優(yōu)點我們已經(jīng)有目共睹。雖然新版本的R的...