相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉(zhuǎn)錄組時，都是在公司做測序，然后數(shù)據(jù)也交給公司分析，又然后，期待做個差異分析，得出像下圖那么完美的熱圖。 然而，然而，，我們得...
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生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM，F(xiàn)PKM -
干貨分享|利用TIDE也能預(yù)測腫瘤免疫逃逸說到免疫檢查點阻斷療法大家應(yīng)該都不陌生，其中，最富盛名的免疫檢查點就是PD-1/PD-L1了。表達(dá)在T細(xì)胞表面的程序性死亡受體（PD-1），與表達(dá)在腫瘤細(xì)胞表面的程序性死亡配...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)中到底應(yīng)該如何處理線粒體基因
什么是線粒體基因 線粒體是參與細(xì)胞凋亡啟動和執(zhí)行的主要細(xì)胞器之一。線粒體基因在大多數(shù)細(xì)胞中表達(dá)，其表達(dá)水平是細(xì)胞類型特異性的。也就是說這個也是和細(xì)胞類型及其狀態(tài)有關(guān)系的。 為...
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bam文件過濾和去重復(fù)
最近處理的幾組數(shù)據(jù)使我感覺到生信軟件的教程一定要看最新的或官方的，因為現(xiàn)在的技術(shù)和方法發(fā)展太快了，軟件更新?lián)Q代也非?？?，每一個版本都可能有細(xì)微的區(qū)別，網(wǎng)上找到的幾年前的教程可...
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DESeq2詳細(xì)用法1.構(gòu)建DESeq2對象 （1）從SummarizedExperiment對象構(gòu)建DESeqDataSet對象 se為RangedSummarizedExperiment對象...
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samtools常用命令詳解
samtools是一個用于操作sam和bam文件的工具集合。 1. view view命令的主要功能是：將輸入文件轉(zhuǎn)換成輸出文件，通常是將比對后的sam文件轉(zhuǎn)換為bam文件，...
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【單細(xì)胞入門必讀】單細(xì)胞RNA-seq技術(shù)和數(shù)據(jù)分析簡介
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis 單細(xì)胞RNA測序(scRNA...
