相信很多科研工作者(不包括比我厲害的大佬們)在做轉(zhuǎn)錄組時(shí),都是在公司做測(cè)序,然后數(shù)據(jù)也交給公司分析,又然后,期待做個(gè)差異分析,得出像下圖那么完美的熱圖。 然而,然而,,我們得...
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說(shuō)到免疫檢查點(diǎn)阻斷療法大家應(yīng)該都不陌生,其中,最富盛名的免疫檢查點(diǎn)就是PD-1/PD-L1了。表達(dá)在T細(xì)胞表面的程序性死亡受體(PD-1),與表達(dá)在腫瘤細(xì)胞表面的程序性死亡配...
什么是線粒體基因 線粒體是參與細(xì)胞凋亡啟動(dòng)和執(zhí)行的主要細(xì)胞器之一。線粒體基因在大多數(shù)細(xì)胞中表達(dá),其表達(dá)水平是細(xì)胞類型特異性的。也就是說(shuō)這個(gè)也是和細(xì)胞類型及其狀態(tài)有關(guān)系的。 為...
最近處理的幾組數(shù)據(jù)使我感覺到生信軟件的教程一定要看最新的或官方的,因?yàn)楝F(xiàn)在的技術(shù)和方法發(fā)展太快了,軟件更新?lián)Q代也非???,每一個(gè)版本都可能有細(xì)微的區(qū)別,網(wǎng)上找到的幾年前的教程可...
1.構(gòu)建DESeq2對(duì)象 (1)從SummarizedExperiment對(duì)象構(gòu)建DESeqDataSet對(duì)象 se為RangedSummarizedExperiment對(duì)象...
samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具集合。 1. view view命令的主要功能是:將輸入文件轉(zhuǎn)換成輸出文件,通常是將比對(duì)后的sam文件轉(zhuǎn)換為bam文件,...
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis 單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA...