相信很多科研工作者（不包括比我厲害的大佬們）在做轉(zhuǎn)錄組時(shí)，都是在公司做測(cè)序，然后數(shù)據(jù)也交給公司分析，又然后，期待做個(gè)差異分析，得出像下圖那么完美的熱圖。 然而，然而，，我們得...
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生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM，F(xiàn)PKM -
干貨分享|利用TIDE也能預(yù)測(cè)腫瘤免疫逃逸說(shuō)到免疫檢查點(diǎn)阻斷療法大家應(yīng)該都不陌生，其中，最富盛名的免疫檢查點(diǎn)就是PD-1/PD-L1了。表達(dá)在T細(xì)胞表面的程序性死亡受體（PD-1），與表達(dá)在腫瘤細(xì)胞表面的程序性死亡配...
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歡迎關(guān)注生信大碗~
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)中到底應(yīng)該如何處理線粒體基因
什么是線粒體基因 線粒體是參與細(xì)胞凋亡啟動(dòng)和執(zhí)行的主要細(xì)胞器之一。線粒體基因在大多數(shù)細(xì)胞中表達(dá)，其表達(dá)水平是細(xì)胞類型特異性的。也就是說(shuō)這個(gè)也是和細(xì)胞類型及其狀態(tài)有關(guān)系的。 為...
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周運(yùn)來(lái)，男，長(zhǎng)大了才會(huì)遇到的帥哥，穩(wěn)健，瀟灑，大方，靠譜。一段生信緣，一棵技能樹。生信技能樹核心成員，單細(xì)胞天地供稿人，簡(jiǎn)書創(chuàng)作者，單細(xì)胞數(shù)據(jù)科學(xué)家。
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bam文件過(guò)濾和去重復(fù)
最近處理的幾組數(shù)據(jù)使我感覺到生信軟件的教程一定要看最新的或官方的，因?yàn)楝F(xiàn)在的技術(shù)和方法發(fā)展太快了，軟件更新?lián)Q代也非?？?，每一個(gè)版本都可能有細(xì)微的區(qū)別，網(wǎng)上找到的幾年前的教程可...
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DESeq2詳細(xì)用法1.構(gòu)建DESeq2對(duì)象 （1）從SummarizedExperiment對(duì)象構(gòu)建DESeqDataSet對(duì)象 se為RangedSummarizedExperiment對(duì)象...
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samtools常用命令詳解
samtools是一個(gè)用于操作sam和bam文件的工具集合。 1. view view命令的主要功能是：將輸入文件轉(zhuǎn)換成輸出文件，通常是將比對(duì)后的sam文件轉(zhuǎn)換為bam文件，...
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Less is more.
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華農(nóng)研究生在讀，生信在學(xué)，可接1對(duì)1保研輔導(dǎo)。
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【單細(xì)胞入門必讀】單細(xì)胞RNA-seq技術(shù)和數(shù)據(jù)分析簡(jiǎn)介
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis 單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA...
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如果你是程序員，或者有一顆喜歡寫程序的心，喜歡分享技術(shù)干貨、項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)、程序員日常囧事等等，歡迎投稿《程序員》專題。 專題主編：小彤花園 http://www.itdecent.cn/users/4a4eb4feee62/ 【程序員】專題拒稿指北：http://www.itdecent.cn/p/7c8b33b5f63b 投稿須知： 1.收錄相關(guān)技術(shù)文章，但不限于技術(shù)，也可以是項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)類的文章和程序員日常。 2.文章內(nèi)不得有任何推廣信息。包括但不限于公眾號(hào)、微博、微信，更不得在通過(guò)投稿后再修改文章加入推廣信息。你可以將這些推廣以及個(gè)人信息放在個(gè)人主頁(yè)介紹里。 3.字?jǐn)?shù)極少，段落混亂，大段代碼沒有放到代碼框的文章不收錄 4.不相關(guān)的內(nèi)容不收錄，請(qǐng)確認(rèn)文章內(nèi)容和本專題相關(guān) 目前針對(duì)優(yōu)質(zhì)作者及愛好者，開設(shè)了官方程序員微信群，希望加入請(qǐng)發(fā)簡(jiǎn)信給主編小彤花園索取個(gè)人微信，主編會(huì)將你加入到【程序員】微信群，分享內(nèi)容，收獲知識(shí)。添加微信時(shí)備注昵稱。
