今天分享一個(gè)實(shí)用的數(shù)據(jù)提取思路：從VCF文件中提取指定列，比如有1000個(gè)樣本，需要從中提取出200個(gè)制定樣本，形成新的vcf文件。需要在Linux環(huán)境下進(jìn)行操作，主要用到p...
發(fā)簡信
IP屬地：重慶
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Linux環(huán)境下利用perl腳本批量篩選VCF文件指定樣本
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人類泛基因組草圖發(fā)布近日，人類泛基因組參考聯(lián)盟（HPRC）在《Nature》雜志上發(fā)表了《人類泛基因組草圖》。相較于我們常用的GRCh37、GRh38 等線性參考基因組，泛基因組在微小變異檢測和...
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最完整的人參考基因組
最近看了一篇人基因組組裝的文章，和大家分享一下。 國際人類基因組測序協(xié)會在2001年發(fā)表了人類基因組草圖，今天這篇文獻(xiàn)2021年5月27由Telomere-to-Telome...
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人類參考基因組知識點(diǎn)(更新ing~)一、人類基因組有多大 參照UCSC提供的hg38版本，也是目前常用的人類參考基因組http://hgdownload.soe.ucsc.edu/goldenPath/hg38...
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2020-01-15 了解人類不同版本參考基因組及如何選擇2013年發(fā)布了GRCh38，每年會在不改變序列和坐標(biāo)的情況下發(fā)布一些Patcheshttps://www.ncbi.nlm.nih.gov/grc/help/patches...
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生信 | 基因組組裝實(shí)戰(zhàn)（一）：基礎(chǔ)知識與基本思路寫在前面 以下內(nèi)容均來自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓(xùn)班課堂筆記 1. Genome de nove 基礎(chǔ)知...
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十問十答| 你想知道的重測序問題都在這了！
1. hg19、GRCh37、GRCh38、B37這4種參考基因組的區(qū)別？ （1）來源： hg19來自UCSC，GRCh37、GRCh38來自NCBI，b37來自千人基因組第...
