個人筆記,內(nèi)容轉(zhuǎn)自曾健民老師 第一個萬能芯片探針I(yè)D注釋R包,整合全部的bioconductor里面的芯片探針注釋包 library(devtools)install_git...
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運行l(wèi)ibrary(harmony)后代碼如下: s.genes <- cc.genes$s.genesg2m.genes <- cc.genes$g2m.genessce....
時代的洪流奔涌而至,單細胞技術(shù)也從舊時王謝堂前燕,飛入尋常百姓家。雪崩的時候,沒有一片雪花是無辜的,你我也從素不相識,到被一起卷入單細胞天地。R語言和Seurat已以勢如破竹...
CellChat三部曲1:使用CellChat對單個數(shù)據(jù)集進行細胞間通訊分析 自從周運來在簡書寫了一篇cellchat的中文介紹教程,然后R包作者也在B站做了直播介紹,cel...
在運行infercnv::run完成后,發(fā)現(xiàn)輸出文件夾下面只有infercnv.observations_dendrogram,而沒有infercnv.observation...
先設(shè)置resolution為大眾化的0.5,初步鑒定各分群是什么細胞,觀察感興趣的分群形狀是否有繼續(xù)分群的趨勢。 采用clustree可視化不同resolution下各分群的...