個人筆記，內(nèi)容轉(zhuǎn)自曾健民老師 第一個萬能芯片探針I(yè)D注釋R包，整合全部的bioconductor里面的芯片探針注釋包 library(devtools)install_git...
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三個萬能芯片探針I(yè)D注釋R包 -
CellCycleScoring報錯
運行l(wèi)ibrary(harmony)后代碼如下： s.genes <- cc.genes$s.genesg2m.genes <- cc.genes$g2m.genessce....
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單細胞測序（sc-RNA seq）分析：Seurat4.0系列教程、高級分析、文章復(fù)現(xiàn)
時代的洪流奔涌而至，單細胞技術(shù)也從舊時王謝堂前燕，飛入尋常百姓家。雪崩的時候，沒有一片雪花是無辜的，你我也從素不相識，到被一起卷入單細胞天地。R語言和Seurat已以勢如破竹...
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CellChat三部曲1：使用CellChat對單個數(shù)據(jù)集進行細胞間通訊分析CellChat三部曲1：使用CellChat對單個數(shù)據(jù)集進行細胞間通訊分析 自從周運來在簡書寫了一篇cellchat的中文介紹教程，然后R包作者也在B站做了直播介紹，cel...
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infercnv跑的結(jié)果中無infercnv.observations.txt
在運行infercnv::run完成后，發(fā)現(xiàn)輸出文件夾下面只有infercnv.observations_dendrogram，而沒有infercnv.observation...
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單細胞分析FindClusters如何選擇resolution
先設(shè)置resolution為大眾化的0.5，初步鑒定各分群是什么細胞，觀察感興趣的分群形狀是否有繼續(xù)分群的趨勢。 采用clustree可視化不同resolution下各分群的...
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