一、簡介 SOAPdenovo2是用于short-read組裝的軟件，能夠組裝出類似人類基因組大小的de novo草圖。SOAPdenovo主要用于大型植物和動物基因組的組裝...
發(fā)簡信
IP屬地：云南
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基因組組裝—SOAPdenovo2的使用 -
測序數(shù)據(jù)的深度、覆蓋度等計(jì)算Coverage Depth 覆蓋深度 mapping depth 基因組被測序片段（短讀 short reads）“覆蓋”的強(qiáng)度有多大？ 每一堿基的覆蓋率是基因組堿基被測序...
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Augustus 基因從頭預(yù)測
目前的從頭預(yù)測軟件大多是基于HMM(隱馬爾科夫鏈)和貝葉斯理論，通過已有物種的注釋信息對軟件進(jìn)行訓(xùn)練，從訓(xùn)練結(jié)果中去推斷一段基因序列中可能的結(jié)構(gòu)，在這方面做的最好的工具是AU...
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生物統(tǒng)計(jì)學(xué) | Fisher精確檢驗(yàn)
最近論文吃緊，本來想搞搞群體多樣性的，無奈沒時(shí)間，為了保持簡書上我這個(gè)號殘余的一點(diǎn)熱乎氣，今天晚上分享一篇8年前寫的舊文，主要講Fisher檢驗(yàn)的，有些不盡如意的地方稍作了一...
