HDOCK是用來做蛋白和蛋白或分子之間對(duì)接的軟件，文章鏈接為：https://doi.org/10.1038/s41596-020-0312-x[https://doi.or...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：云南
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HDOCK分子對(duì)接
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RNA velocity分析練習(xí)（四）聚類以及velocity可視化系列回顧：1.RNA velocity分析練習(xí)（一）文件下載以及預(yù)處理2.RNA velocity分析練習(xí)（二）軟件安裝3.RNA velocity分析練習(xí)（三）生成loom...
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非模式生物KEGG富集分析寫在前面 因?yàn)槲已芯康奈锓N比較小眾，很多注釋不完全，R包AnnotationHub中也沒有對(duì)應(yīng)信息，所以無法使用公共數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行kegg富集分析。所以自己嘗試使用KAAS造一個(gè)...
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「生信軟件」細(xì)菌質(zhì)粒組裝
pATLAS smaegol/PlasFlow BU-ISCIII/plasmidID phac-nml/mob-suite zhenchengfang/PPR-Meta S...
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TCGA 拷貝數(shù)變異（CNV）數(shù)據(jù)整理（一）
zhuang_gj 3月-09-2021 從TCGA下載Masked Copy Number Segment 數(shù)據(jù)-----解壓后進(jìn)行處理 marker file數(shù)據(jù)下載和處...
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TCGA生存模型的構(gòu)建以及模型預(yù)測(cè)和評(píng)估生存模型的構(gòu)建方法包括：1. Lasso回歸；2. Cox多因素回歸；3. 隨機(jī)森林；4. 支持向量機(jī) 可以把log_rank_test或cox篩選出的基因單獨(dú)做模型構(gòu)建，也...
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GSEA和GSVA，再也不用去下載gmt文件咯前言 我是在y蜀黍的書里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一個(gè)叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集合都R語(yǔ)言化了。那么以后想做G...
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ggpubr包繪制SCI文章圖（基礎(chǔ)知識(shí)）最近年中總結(jié)，我們學(xué)習(xí)一些基礎(chǔ)知識(shí)，還有幾天總結(jié)就結(jié)束了，期待FFPE做空間轉(zhuǎn)錄組大放異彩 安裝及加載ggpubr包 安裝方式有兩種： 直接從CRAN安裝： 從GitHub上...
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單基因TCGA的Cox森林圖怎么畫才好看首先調(diào)取Xena網(wǎng)頁(yè)的TCGA數(shù)據(jù)做Cox生存分析，數(shù)據(jù)可以通過hiplot官網(wǎng)自主研發(fā)的ucsc-xena-shiny直接在線獲取訪問https://hiplot.com....
