Phytozome 作為專門(mén)收錄植物基因組的網(wǎng)站,在基因組數(shù)據(jù)的下載、查詢、可視化瀏覽等方面做的都很不錯(cuò)。為了下載整個(gè)Phytozome數(shù)據(jù)庫(kù)，我先后使用了requests庫(kù)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：福建
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使用Python3下載Phytozome數(shù)據(jù)庫(kù)
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外顯子、內(nèi)含子、mRNA,CDS區(qū)別關(guān)于基因理論知識(shí)補(bǔ)充：外顯子、內(nèi)含子、mRNA,CDS區(qū)別 1、DNA復(fù)制：以DNA為模板，在DNA聚合酶的催化作用下，將四種游離的dNTP按照堿基互補(bǔ)配對(duì)原則合成新鏈DNA...
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[轉(zhuǎn)載]清晰易懂的NGS原理和流程
1 測(cè)序技術(shù)2FASTA和FASTQ3數(shù)據(jù)質(zhì)控4構(gòu)建WGS主流程理解并操作BAM文件 GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上）GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（下） 癌...
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我的生信自學(xué)心得分享
這是我2022-02-16在CGM分享的文字稿 從2016年，我開(kāi)始自學(xué)生物信息，那個(gè)時(shí)候，為了加深自己學(xué)習(xí)，所以就不間斷的在網(wǎng)上分享我的學(xué)習(xí)筆記。 我有一個(gè)自己的博客，xu...
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AWK基礎(chǔ)教程前言 之前針對(duì)WorkerHub小程序做的數(shù)據(jù)分析文章 互聯(lián)網(wǎng)卷王花落誰(shuí)家？[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2Mjc0ODk1Ng=...
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#! /bin/bashbackground 你可能經(jīng)常會(huì)在一個(gè)shell script file(.sh文件)，或者一個(gè)寫(xiě)滿shell scirpt的text文件的開(kāi)頭看到這樣一行代碼： 為什么要...
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通過(guò)blast在基因組中找相似序列人類基因組中存在大量的重復(fù)區(qū)域，給定一段序列，如何知道這段序列在基因組中是否具有唯一比對(duì)，或者具有多個(gè)比對(duì)？ 一種方法是通過(guò)bwa，通過(guò)AS和XS 標(biāo)簽判斷是否有次優(yōu)比對(duì)；但...
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GFF文件和基因組文件提取mRNA,cds,protein序列首先是用gffread提取cds序列,蛋白序列,轉(zhuǎn)錄本序列 接下來(lái)我們利用組合工具來(lái)提取mRNA,和gene序列 注意用bedtools提取序列，要加-s 參數(shù)（能區(qū)分正反鏈...
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CRISPR-Cas9基因編輯技術(shù)簡(jiǎn)介CRISPR-Cas9是繼ZFN、TALENs等基因編輯技術(shù)推出后的第三代基因編輯技術(shù)，短短幾年內(nèi),CRISPR-Cas9技術(shù)風(fēng)靡全球, 成為現(xiàn)有基因編輯和基因修飾里面效率最...
