上百個(gè)動(dòng)植物基因組組裝（華中農(nóng)已畢業(yè)的生物狗）的分析小經(jīng)驗(yàn)~不定時(shí)記錄日常搬磚踩坑記錄~<br>學(xué)無止境，溫故而知新~說清楚問題，有問有回，禮貌的人才能得到回復(fù)
發(fā)簡(jiǎn)信
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@靜默浩然 謝謝
如何使用snpEff創(chuàng)建本地?cái)?shù)據(jù)庫
snpEff的使用是在Linux系統(tǒng)中Java運(yùn)行環(huán)境下。 一、下載snpEff 方法一： 直接在家目錄下載使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...
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歡迎關(guān)注微信公眾號(hào)<生信修煉手冊(cè)><br>關(guān)注公眾號(hào)，可以加入微信群，一起交流溝通
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大齡博士在讀
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建立數(shù)據(jù)庫后，我的數(shù)據(jù)庫目錄下沒有產(chǎn)生一個(gè)".bin"文件，但是grep -i 后可以看到自己建立的數(shù)據(jù)連接。這算是成功建立數(shù)據(jù)庫了嗎？但是注冊(cè)vcf文件時(shí)，卻顯示 ERROR while connecting to http://downloads.sourceforge.net/project/snpeff/databases/v4_3/snpEff_v4_3_IRGSP-1.0.zip
java.lang.RuntimeException: java.lang.RuntimeException: File not found on the server. Make sure the database name is correct.
請(qǐng)問這是為什么呢？如何使用snpEff創(chuàng)建本地?cái)?shù)據(jù)庫
snpEff的使用是在Linux系統(tǒng)中Java運(yùn)行環(huán)境下。 一、下載snpEff 方法一： 直接在家目錄下載使用命令 wgethttp://sourceforge.net/p...
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群體遺傳筆記（一）：群體間選擇信號(hào)的檢測(cè)及GO注釋從獲取下機(jī)數(shù)據(jù)做質(zhì)控、比對(duì)，到calling snp獲得vcf文件這一步，網(wǎng)上已經(jīng)有非常詳細(xì)的教程，有GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上），還有Samtools+bcf...
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