發(fā)簡信
IP屬地：云南
-
-
GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析流程（BWA+samtools+gatk+Plink+Admixture+Tassel）
我梳理了GWAS全基因組關(guān)聯(lián)分析的整個(gè)流程，并提供了基本的命令，用到的軟件包括BWA、samtools、gatk、Plink、Admixture、Tassel等，在此分享出來...
-
公眾號：【 APP實(shí)驗(yàn)室 】，歡迎關(guān)注<br>專注于發(fā)現(xiàn)好玩、好用的工具、軟件。<br>wx: Ivannnnn9<br>
-
Excalidraw：超好用的在線白板APP實(shí)驗(yàn)室“日更挑戰(zhàn)”，每天為你帶來一款好用、好玩的工具軟件 今天，APP實(shí)驗(yàn)室推薦給大家的是一款超級好用的在線繪圖工具，Excalidraw。 Excalidraw：在線...
-
你好，我想問一下在測試rMATS時(shí)是不是使用的事他們自己的測試數(shù)據(jù)啊？他們數(shù)據(jù)的readLength不是50嘛？為什么你101也能跑起來呀？不會報(bào)錯(cuò)嘛？
RBP AS生信流程（ 四）rMATs
rMATs rMATs運(yùn)行： 在rMATstest這個(gè)文件夾里有官網(wǎng)下載好的2x2測試文件： 用samtools查看bam文件： 可以看到第三列為1，代表1號染色體（這里是1...
-
喜歡寫代碼的外科醫(yī)生。
-
-
@hu巴 抱歉，原作者撤了文章我也不能再傳播啦
【CIBERSORT】超詳細(xì)，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析（初學(xué)者筆記）
【CIBERSORT】超詳細(xì)，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析全過程(初學(xué)者筆記) cibersort是目前引用次數(shù)最多的免疫細(xì)胞浸潤估計(jì)分析工具，2015年首次發(fā)表于nature me...
-
求助！如果報(bào)錯(cuò)說"there is no package called panc8.SeuratData"該怎么辦啊
SeuratData||你需要的單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析實(shí)例數(shù)據(jù)合集
SeuratData是一種使用R的內(nèi)部包和數(shù)據(jù)管理系統(tǒng)以Seurat對象的形式分發(fā)數(shù)據(jù)集的機(jī)制。它代表了一種方便用戶訪問Seurat中使用的數(shù)據(jù)集的方法。 我們創(chuàng)建了seur...
-
GEO數(shù)據(jù)挖掘小嘗試：（三）利用clusterProfiler進(jìn)行富集分析clusterProfiler 是業(yè)界大神Y叔寫的一個(gè)R包，可以用來做各種富集分析，如GO、KEGG、DO（Disease Ontology analysis）、Reacto...
-
教你畫一個(gè)掰彎的熱圖（Heatmap），展示更多的基因表達(dá)量難道，這不像孔雀開屏嗎？ 寫在前面 組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)泛濫，但是信息的挖掘仍任重道遠(yuǎn)。順手的工具，可以節(jié)省使用者盡可能多的時(shí)間，或者將看起來很復(fù)雜，很難以完成的事情，變得非常簡單。...
-
-
@鄭寶童 謝謝呀~
[R]用R執(zhí)行cibersort，根據(jù)組織的基因表達(dá)譜獲取細(xì)胞的百分比
CIBERSORT is an analytical tool developed by Newman et al. to provide an estimation of ...
-
【CIBERSORT】超詳細(xì)，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析（初學(xué)者筆記）【CIBERSORT】超詳細(xì)，從數(shù)據(jù)下載到數(shù)據(jù)分析全過程(初學(xué)者筆記) cibersort是目前引用次數(shù)最多的免疫細(xì)胞浸潤估計(jì)分析工具，2015年首次發(fā)表于nature me...
-
你們都是善良的人
