一. 讀取數(shù)據(jù) 因為我們一般自己錄的數(shù)據(jù)都是excel表格的，對于讀取excel，此處有一個小技巧 讀取excel方法 1.把excel文件另存為CSV文件 2.按照讀取cs...
IP屬地：廣東
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用R語言進行相關(guān)性分析：畫出散點圖、擬合線及標(biāo)注相關(guān)系數(shù)和P值 -
refseqID轉(zhuǎn)換為geneID（2018-06-05）
1 refseqID轉(zhuǎn)換成geneID 下載gene2refseq.gz 2 提取相似物種的基因 gene2refseq.csv文件較大，有4G多，所以將blast比對過的物...
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特定的腫瘤數(shù)據(jù)庫
子宮頸癌基因數(shù)據(jù)庫 Cervical Cancer gene DataBase (CCDB) http://crdd.osdd.net/raghava/ccdb/faq.ph...
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R包SCENIC:結(jié)果可視化與分析
1.鑒定細(xì)胞狀態(tài) 以t-SNE圖呈現(xiàn)AUC評分和TF表達情況（即調(diào)控元件的活動度） 利用AUC 交互app（Scope） logMat <- exprMat # Better...
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2019-06-27 scenic: single-cell regulatory network inference and clustering
title：scenic: single-cell regulatory network inference and clustering journal：Nature me...
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R包SCENIC：分析流程
GRN：基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò) 分為四步進行GRN分析 1.GENIE3/GRNBoost：基于共表達情況鑒定每個TF的潛在靶點; 過濾表達矩陣并運行R包GENIE3/GRNBoost...
