最近做了天然胸腺單細(xì)胞測(cè)序結(jié)果的分析,我在GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中下載了10個(gè)樣本(GSE182135),完整的的代碼如下,做一個(gè)記錄,還在摸索階段,如果有不對(duì)的地方也請(qǐng)大佬們指正。后...
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題目: Zoledronate facilitates large-scale ex vivo expansion of functional γδT cells fro...
作為一個(gè)生物信息工程師,看到這樣的圖,請(qǐng)解釋。 為什么CD14+ Mono和 Memory CD4 T 有怎么多的點(diǎn),卻沒有小提琴呢? 那, 我們要看看作圖細(xì)節(jié)了。 可惜并...
在群里看到有同學(xué)進(jìn)行了如下提問,看起來很簡(jiǎn)單的代碼,但嘗試運(yùn)行確實(shí)顯示pdf文件已損壞。這就勾起了我的好奇心。涉及到的知識(shí)點(diǎn)其實(shí)就是 if 條件語句。 先來看一下我的解決方案...
常用的細(xì)胞通訊軟件:CellphoneDB[http://www.itdecent.cn/p/38a9376f5286]:是公開的人工校正的,儲(chǔ)存受體、配體以及兩種相互作用...
NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)下載單細(xì)胞測(cè)序原始SRA數(shù)據(jù) 如果想要分析數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù),可以從文獻(xiàn)中獲得數(shù)據(jù)的GSE號(hào),舉個(gè)例子:image.png 然后到NCBINational Cent...
昨天在服務(wù)器上安裝好node之后,提示這個(gè)錯(cuò)誤:./node: /lib64/libc.so.6: version `GLIBC_2.17' not found (requi...
軌跡分析系列: 單細(xì)胞之軌跡分析-1:RNA velocity[http://www.itdecent.cn/p/ee0f7a8e6a06] 擬時(shí)間序列分析(Pseudot...
細(xì)胞類型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...