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  • 樓主,想問(wèn)一下是哪本書?

    GSEA和GSVA,再也不用去下載gmt文件咯

    前言 我是在y蜀黍的書里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一個(gè)叫msigdbr的包,就是把MsigDB的那些基因集合都R語(yǔ)言化了。那么以后想做G...

  • 樓主,我想問(wèn)你啊,這個(gè)基因集采用的是什么GO還是KEGG啊,這GSEA怎么又混入了KEGG和GO了,基因集不是MsigDB里面的嗎,什么hallmark等等,這是什么呀,這么亂。。。

    基因集富集分析(GSEA)及其可視化

    1 什么是GSEA 基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)是是一種計(jì)算方法,用于確定事先定義的一組基因是否在不同的樣品中差異表...

  • TCGA / 癌癥簡(jiǎn)稱 / 縮寫 / TCGA癌癥中英文對(duì)照

    TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中含有的癌癥名稱,簡(jiǎn)寫和中文名稱 Abbr英文名稱中文名稱ACCAdrenocortical carcinoma腎上腺皮質(zhì)癌BLCABladder Urothe...

  • TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)與數(shù)據(jù)下載

    TCGA數(shù)據(jù)庫(kù):主要儲(chǔ)存關(guān)于各類腫瘤的一個(gè)基本信息,包括RNAseq,miRNAseq,DNA甲基化,CNV,SNP等信息,是目前為止可以獲得的公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)里面數(shù)據(jù)相對(duì)全面的一...

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