第七節(jié):空間轉(zhuǎn)錄組分析 在本節(jié)教程中,我們將學(xué)習(xí)空間轉(zhuǎn)錄組的一些分析方法。10X Visium平臺(tái)的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)在許多方面是類似于scRNA-seq數(shù)據(jù)的,它包含5-20個(gè)...
第七節(jié):空間轉(zhuǎn)錄組分析 在本節(jié)教程中,我們將學(xué)習(xí)空間轉(zhuǎn)錄組的一些分析方法。10X Visium平臺(tái)的空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)在許多方面是類似于scRNA-seq數(shù)據(jù)的,它包含5-20個(gè)...
Single-nucleus transcriptome analysis reveals dysregulation of angiogenic endothelial c...
有很多的生信軟件都可以通過(guò)conda安裝,省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件,conda一行命令就搞定了。前兩天有個(gè)胖友問(wèn)我gatk 3.8的版本在哪里...
第一步:用conda 安裝 SRA-tools conda install sra-tools 第二步 建立文件夾 存儲(chǔ)數(shù)據(jù) 第三步 數(shù)據(jù)下載 方法一: fast-dump ...
轉(zhuǎn)錄組分析是生信分析的一個(gè)基礎(chǔ)和常見(jiàn)的分析流程,一般從下機(jī)數(shù)據(jù)開(kāi)始,經(jīng)過(guò)一系列的質(zhì)控,基因組比對(duì),差異分析等過(guò)程得到實(shí)驗(yàn)組與對(duì)照組(或者腫瘤中的轉(zhuǎn)移組和原癌組)中差異表達(dá)的基...
以下是B站生信技能樹(shù)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的: 介紹GEO數(shù)據(jù)庫(kù):了解數(shù)據(jù)存放位置; 介紹GSE項(xiàng)目的3種下載方式; 介紹ID轉(zhuǎn)換:使用R語(yǔ)言技巧實(shí)現(xiàn)基...
生信人應(yīng)這樣學(xué)R語(yǔ)言-生信技能樹(shù)視頻 一、介紹R語(yǔ)言及Rstudio 1、R是用于統(tǒng)計(jì)分析、繪圖的語(yǔ)言和操作環(huán)境。R是屬于GNU系統(tǒng)的一個(gè)自由、免費(fèi)、源代碼開(kāi)放的軟件,它是一...
積跬步,至千里 1.介紹R語(yǔ)言及RStudio 1.1 安裝R 包和Rstudio1.2Rstudio四個(gè)區(qū)塊,區(qū)塊,history(to source,to console...