1.默認安裝v4版本 2.因為有個去批次的R包(iSMNN)需要安裝V3版本的Seurat,所以我需要安裝Seurat v3版本但是在此過程中一直在報錯: 發(fā)現(xiàn)只有spats...
寫在前面的廢話 這篇文章來自于一個舔狗的悲哀,謹以此文告訴大家莫當舔狗…… 以上聊天記錄,就是整個故事背景。當時我的內(nèi)心歷程: 我看過類似的文章欸,趕緊發(fā)出來展現(xiàn)一下我的閱讀...
在安裝cytoTRACE的時候,除了之前所需要的更高版本的GCC,此外,它還需要nc-config這個依賴庫,這在我們組服務(wù)器也是沒有的,在沒有root權(quán)限下,我們該如何安裝...
一.安裝R包的方式: 由于R包發(fā)布在cran上的包非常嚴格所以很多功能強大的包并不能直接在cran上下載到--也就是說用 install.package 命令無法下載,這是后...
一句話總結(jié):利用空間轉(zhuǎn)錄方法在單細胞分辨率下探索人類心臟發(fā)育的基因表達圖景,以構(gòu)建一個3D器官范圍的圖譜。 Highlights Profiled spatiotempora...
很多做單細胞的研究者都提出過這個問題,是否有直接的功能能對單細胞直接進行注釋,而不是繁瑣的參看文獻,搜索marker,人為對單細胞進行注釋。單細胞真的可以實現(xiàn)自動化注釋嗎?我...
單細胞分析不可避免的會涉及到鑒定不同細胞類型的功能或比較相同類型在不同狀態(tài)下的功能差異,因此,功能分析在單細胞分析中相當重要. 功能分析的方法很多,這兒我們主要講述3種功能分...
首先SingleR屬于不基于Prior Knowledge的注釋方法;相對應的還有基于Prior Knowledge的方法,比如CellAssign,但兩個用起來都不是很順手...