平臺(tái)：Linux 服務(wù)器、Rstudio數(shù)據(jù)：NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)（SRR2932830） 1.下載序列 參考 菜鳥自學(xué)之——SRA Toolkit 的下載和使用https://b...
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從序列到表達(dá)矩陣 -
轉(zhuǎn)錄組分析(3) - 質(zhì)量控制目的 現(xiàn)在的NGS測(cè)序，以illumina為首基本都是運(yùn)用邊合成邊測(cè)序的技術(shù)。堿基的合成依靠的是化學(xué)反應(yīng)，這使得堿基鏈可以不斷地從5'端一直往3'端合成并延伸下去。但在這個(gè)合...
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轉(zhuǎn)錄組分析(2) - 軟件安裝
conda環(huán)境創(chuàng)建 conda create -n py3 python=3.8conda create -n py2 python=2.7 數(shù)據(jù)預(yù)處理軟件 conda ac...
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轉(zhuǎn)錄組分析(1) - 基礎(chǔ)介紹轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)，廣義上指某一生理?xiàng)l件下，細(xì)胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運(yùn)RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合。轉(zhuǎn)...
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使用python處理生物信息數(shù)據(jù)（八）
Python學(xué)習(xí)的第八天，主要學(xué)習(xí)文本挖掘和模式匹配。 生物信息大多數(shù)問(wèn)題都是核酸或氨基酸序列的比對(duì)和尋找motif，利用正則表達(dá)式顯得十分重要。比如一條核酸或氨基酸序列，你...
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使用python處理生物信息數(shù)據(jù)（五）Python學(xué)習(xí)的第五天，主要學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)的過(guò)濾。 1. 轉(zhuǎn)錄組差異分析數(shù)據(jù)的過(guò)濾 Cuffcompare軟件進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組表達(dá)量的比較和統(tǒng)計(jì)，至少存在于3個(gè)生物學(xué)重復(fù)中的兩個(gè)樣本...
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全國(guó)計(jì)算機(jī)信息高新技術(shù)考試生物信息分析（中級(jí)）?考試大綱
全國(guó)計(jì)算機(jī)信息高新技術(shù)考試生物信息分析（中級(jí)） 考 試 大 綱 第一單元 基因組學(xué)相關(guān)基礎(chǔ)知識(shí)（8分） 1、人類基因組組成與遺傳規(guī)律：DNA的分子結(jié)構(gòu)、DNA復(fù)制方式、人類基...
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做生物信息，你需要多少內(nèi)存?
做生物信息，你需要多少內(nèi)存? 原創(chuàng) 基因?qū)W苑 做生物信息，需要多少內(nèi)存，經(jīng)常有人問(wèn)我分析的內(nèi)存消耗情況，比如拼接基因組需要多少內(nèi)存，轉(zhuǎn)錄組需要多少內(nèi)存，宏基因組需要多少內(nèi)存，...
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怎么讀文獻(xiàn)、管理文獻(xiàn)、寫綜述？
怎么讀文獻(xiàn)、管理文獻(xiàn)、寫綜述？這篇文章講透了！ 三峽大學(xué)研究生會(huì) 讀文獻(xiàn)、管理文獻(xiàn)、寫綜述對(duì)于研究生來(lái)說(shuō)非常的重要，那么怎么讀文獻(xiàn)、管理文獻(xiàn)、寫綜述呢？本篇文章將會(huì)對(duì)您有所啟...
