平臺：Linux 服務(wù)器、Rstudio數(shù)據(jù)：NCBI數(shù)據(jù)庫（SRR2932830） 1.下載序列 參考 菜鳥自學(xué)之——SRA Toolkit 的下載和使用https://b...
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轉(zhuǎn)錄組分析(3) - 質(zhì)量控制目的 現(xiàn)在的NGS測序，以illumina為首基本都是運用邊合成邊測序的技術(shù)。堿基的合成依靠的是化學(xué)反應(yīng)，這使得堿基鏈可以不斷地從5'端一直往3'端合成并延伸下去。但在這個合...
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轉(zhuǎn)錄組分析(2) - 軟件安裝
conda環(huán)境創(chuàng)建 conda create -n py3 python=3.8conda create -n py2 python=2.7 數(shù)據(jù)預(yù)處理軟件 conda ac...
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轉(zhuǎn)錄組分析(1) - 基礎(chǔ)介紹轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)，廣義上指某一生理條件下，細胞內(nèi)所有轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的集合，包括信使RNA、核糖體RNA、轉(zhuǎn)運RNA及非編碼RNA；狹義上指所有mRNA的集合。轉(zhuǎn)...
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使用python處理生物信息數(shù)據(jù)（八）
Python學(xué)習(xí)的第八天，主要學(xué)習(xí)文本挖掘和模式匹配。 生物信息大多數(shù)問題都是核酸或氨基酸序列的比對和尋找motif，利用正則表達式顯得十分重要。比如一條核酸或氨基酸序列，你...
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使用python處理生物信息數(shù)據(jù)（五）Python學(xué)習(xí)的第五天，主要學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)的過濾。 1. 轉(zhuǎn)錄組差異分析數(shù)據(jù)的過濾 Cuffcompare軟件進行了轉(zhuǎn)錄組表達量的比較和統(tǒng)計，至少存在于3個生物學(xué)重復(fù)中的兩個樣本...
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全國計算機信息高新技術(shù)考試生物信息分析（中級）?考試大綱
全國計算機信息高新技術(shù)考試生物信息分析（中級） 考 試 大 綱 第一單元 基因組學(xué)相關(guān)基礎(chǔ)知識（8分） 1、人類基因組組成與遺傳規(guī)律：DNA的分子結(jié)構(gòu)、DNA復(fù)制方式、人類基...
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做生物信息，你需要多少內(nèi)存?
做生物信息，你需要多少內(nèi)存? 原創(chuàng) 基因?qū)W苑 做生物信息，需要多少內(nèi)存，經(jīng)常有人問我分析的內(nèi)存消耗情況，比如拼接基因組需要多少內(nèi)存，轉(zhuǎn)錄組需要多少內(nèi)存，宏基因組需要多少內(nèi)存，...
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怎么讀文獻、管理文獻、寫綜述？
怎么讀文獻、管理文獻、寫綜述？這篇文章講透了！ 三峽大學(xué)研究生會 讀文獻、管理文獻、寫綜述對于研究生來說非常的重要，那么怎么讀文獻、管理文獻、寫綜述呢？本篇文章將會對您有所啟...
