整理了QIIME 2 16S擴(kuò)增子分析流程常用的命令和可視化結(jié)果的圖文解釋，挑選了非常基礎(chǔ)實(shí)用的部分做一個(gè)QIIME 2 學(xué)習(xí)大禮包（沒錯(cuò)就是這篇文章）。東西太多就不搬運(yùn)到簡...
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關(guān)于我總結(jié)的QIIME 2 16S擴(kuò)增子分析流程
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擴(kuò)增子聚類之術(shù)語“ seed ”
前面的swarm聚類文章中講到過，“ seed ” 是 de novo 思想的算法在聚類時(shí)，選擇的第一個(gè)作為質(zhì)心或起點(diǎn)的高豐度擴(kuò)增子，它通常作為 cluster 的代表序列參...
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16S 擴(kuò)增子分析工具：Swarm 聚類OTU流程介紹前段時(shí)間為了寫資料而搜尋 swarm 相關(guān)內(nèi)容無果，在谷歌學(xué)術(shù)翻到一篇 swarm 的學(xué)術(shù)論文（嚴(yán)格來說就是 swarm 的paper），在學(xué)習(xí)過程中主要對 swarm 的工...