1.加載數(shù)據(jù) 2.執(zhí)行默認(rèn)的差異表達(dá)測試 Seurat 的大部分差異表達(dá)特征可以通過“FindMarkers()”函數(shù)訪問。 默認(rèn)情況下,Seurat 基于非參數(shù) Wilco...
1.加載數(shù)據(jù) 2.執(zhí)行默認(rèn)的差異表達(dá)測試 Seurat 的大部分差異表達(dá)特征可以通過“FindMarkers()”函數(shù)訪問。 默認(rèn)情況下,Seurat 基于非參數(shù) Wilco...
============================================寫在前面:可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做?[https://www.jians...
文章目錄 加載R包和輸入數(shù)據(jù) 表達(dá)數(shù)據(jù)整理3.edgeR包做差異表達(dá)4.limma包做差異表達(dá)5.DESeq2包做差異表達(dá)6.比較三種包差異表達(dá)基因篩選結(jié)果 1. 加載R包和...
寫這篇文章一部分原因是填2年前的一個(gè)坑 轉(zhuǎn)錄組入門(7):差異表達(dá)分析. 另一部分原因是GQ最近又在搞一波無重復(fù)的差異表達(dá)分析, 所以專門去學(xué)了edgeR 我個(gè)人是不太推薦...
本期解讀 iTRAQ-based quantitative proteomic reveals proteomic changes in Serratia sp. CM01 ...
轉(zhuǎn)錄因子 (transcription factors, TFs) 是直接作用于基因組,與特定DNA序列結(jié)合 (TFBS/motif) ,調(diào)控DNA轉(zhuǎn)錄過程的一類蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄...
今天學(xué)習(xí)繪制下面這個(gè)paper里面的一個(gè)圖。 從圖中,可以看出,圖片分成2個(gè)部分,左邊是進(jìn)化樹,右邊是類似氣泡圖。 下面我們用一組簡單的文件進(jìn)行測試: 進(jìn)化樹文件: (((A...