今天，分享一篇浙大樊老師和華大發(fā)表在Developmental Cell 上的，題目是“Spatiotemporal transcriptomic landscape of ...
發(fā)簡信
IP屬地：河南
-
【文獻(xiàn)分享】水稻種胚單細(xì)胞時(shí)空圖譜 -
【文獻(xiàn)分享】玉米雌穗空間轉(zhuǎn)錄組圖譜今天分享一篇空間轉(zhuǎn)錄組的文章，在Nature Plants發(fā)表的題為“”A spatial transcriptome map of the developing maize...
-
【微生物文獻(xiàn)】The Populus holobiont dissecting the effects of plant niches and genotype on the microbiome微生物在許多宿主生物中發(fā)揮著重要作用。想要了解從根際土壤到植物冠層不同生態(tài)位的微生物變化，必須更好地了解微生物組成和功能。今天分享1篇有關(guān)楊樹的微生物組相關(guān)的文章“The P...
-
【微生物文獻(xiàn)】Host genetic determinants drive compartment-specific assembly of tea plant microbiomes植物微生物通常被稱為植物的第二套基因組，利用微生物來輔助育種也越來越常見。盡管鑒定了很多植物有益微生物，但是宿主基因型對于微生物的組裝還很有限。近年來，也越來越多的作物開始探...
-
【微生物文獻(xiàn)】Heritable microbiome variation is correlated with source environment in locally adapted ma...今天分享1篇揭示玉米與根際有益微生物互作的遺傳調(diào)控及環(huán)境適應(yīng)性機(jī)理的文章，最近發(fā)表在NP上面。 =======實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)======= 在這個(gè)研究中，選取了129份玉米材料，其...
-
【微生物文獻(xiàn)】Longitudinal profiling of the microbiome at four body sites reveals core stability and ind...今天分享一篇，3月12日發(fā)表在 Cell 旗下的 Cell Host & Microbe 期刊中的一篇文章。 每個(gè)人身體中包含數(shù)以萬億計(jì)的細(xì)菌，通常被稱為微生物組。每個(gè)人體內(nèi)...
-
【嫁接文獻(xiàn)】植物通過b-1,4-葡聚糖酶促進(jìn)植物之間的嫁接最近一直在學(xué)習(xí)植物再生能力方面的知識。今天分享一篇2020年發(fā)表在science上的一篇文章，根據(jù)報(bào)道，題目是《Cell-cell adhesion in plant gra...
-
【微生物文獻(xiàn)】碳納米溶膠重塑植物根際微生物今天分享一篇我們自己的文章。發(fā)在《Journal of Nanobiotechnology》的題目為：“Carbon nanosol-induced assemblage o...
-
【微生物文獻(xiàn)】根際有益微生物VOC促進(jìn)植物生長今天分享一篇，最近發(fā)在Nature Ecology & Evolution的paper：Microbe-induced phenotypic variation leads ...
-
【文獻(xiàn)分享】玉米胚乳單細(xì)胞圖譜最近，中國農(nóng)業(yè)大學(xué)在Nature Communications發(fā)表了題為“Decoding the gene regulatory network of endosperm ...
-
【微生物文獻(xiàn)】葉際微生物抑制病原微生物新機(jī)制最近，雜交水稻全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在Nature Communications發(fā)表了題為“Microbiome homeostasis on rice leaves is regu...
-
【文獻(xiàn)分享】單細(xì)胞揭示谷類作物的性狀進(jìn)化今天分享一篇做植物單細(xì)胞進(jìn)化分析方面的文章，動物里面看過好幾篇經(jīng)典的給予單細(xì)胞數(shù)據(jù)的進(jìn)化分析，植物里面還見的比較少，也就是偶爾在一些文章里面做下比如擬南芥和水稻的比較分析而已...
-
【DoRothEA】單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子分析今天學(xué)習(xí)另外一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子活性預(yù)測工具：DoRothEA。很多文章用的也是這個(gè)工具，看起來比pySCENIC好像快很多。其實(shí)，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子分析本質(zhì)上是計(jì)算一種specific...
-
【文獻(xiàn)分享】空間轉(zhuǎn)錄組解析宿主-細(xì)菌-真菌互作今天分享一篇發(fā)表在NBT上的一篇叫做“Spatial metatranscriptomics resolves host-bacteria-fungi interactome...
-
【跟著CNS來作圖2】復(fù)雜熱圖今天我們嘗試復(fù)現(xiàn)一個(gè)熱圖，下面圖C的右邊部分。 下載附表的原始數(shù)據(jù)。 首先加載需要的包： library(xlsx) library(ComplexHeatmap) libr...
-
【文獻(xiàn)分享】單細(xì)胞水平棉花萜類物質(zhì)合成與調(diào)控機(jī)制今天分享一篇發(fā)表在MP上面的一個(gè)paper，是中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心發(fā)表的，題目為"Single-cell RNA sequencing reveals a hi...
-
【文獻(xiàn)分享】單細(xì)胞水平下光信號對擬南芥細(xì)胞命運(yùn)決定的調(diào)控機(jī)制光是植物生長發(fā)育最重要的調(diào)控因子，不僅為植物提供能源，還作為信號因子調(diào)控植物發(fā)育的整個(gè)生活史。其中，光、暗條件下幼苗的形態(tài)建成是光信號調(diào)控植物發(fā)育最顯著的表現(xiàn)形式：暗中生長的...
-
【文獻(xiàn)分享】棉花根鹽處理單細(xì)胞圖譜土壤鹽堿化問題日益嚴(yán)峻，已經(jīng)成為全球范圍內(nèi)制約植物生長發(fā)育的主要環(huán)境因子之一。根系在植物應(yīng)答逆境脅迫中具有重要的調(diào)節(jié)作用，作為環(huán)境脅迫下最先感知并作出反應(yīng)的器官，其耐逆機(jī)理還...
-
【文獻(xiàn)分享】單細(xì)胞揭示擬南芥真菌侵染植物免疫過程植物病害對全球糧食安全構(gòu)成了重大威脅，了解植物疾病發(fā)生機(jī)制，對制定有效的病原菌防御策略具有重大影響。但是，由于病原菌在宿主體內(nèi)是一個(gè)動態(tài)過程，不同植物細(xì)胞和組織對病原菌的精確...