今天,分享一篇浙大樊老師和華大發(fā)表在Developmental Cell 上的,題目是“Spatiotemporal transcriptomic landscape of ...
今天,分享一篇浙大樊老師和華大發(fā)表在Developmental Cell 上的,題目是“Spatiotemporal transcriptomic landscape of ...
今天分享一篇空間轉(zhuǎn)錄組的文章,在Nature Plants發(fā)表的題為“”A spatial transcriptome map of the developing maize...
微生物在許多宿主生物中發(fā)揮著重要作用。想要了解從根際土壤到植物冠層不同生態(tài)位的微生物變化,必須更好地了解微生物組成和功能。今天分享1篇有關(guān)楊樹的微生物組相關(guān)的文章“The P...
植物微生物通常被稱為植物的第二套基因組,利用微生物來輔助育種也越來越常見。盡管鑒定了很多植物有益微生物,但是宿主基因型對于微生物的組裝還很有限。近年來,也越來越多的作物開始探...
今天分享1篇揭示玉米與根際有益微生物互作的遺傳調(diào)控及環(huán)境適應(yīng)性機(jī)理的文章,最近發(fā)表在NP上面。 =======實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)======= 在這個(gè)研究中,選取了129份玉米材料,其...
今天分享一篇,3月12日發(fā)表在 Cell 旗下的 Cell Host & Microbe 期刊中的一篇文章。 每個(gè)人身體中包含數(shù)以萬億計(jì)的細(xì)菌,通常被稱為微生物組。每個(gè)人體內(nèi)...
最近一直在學(xué)習(xí)植物再生能力方面的知識。今天分享一篇2020年發(fā)表在science上的一篇文章,根據(jù)報(bào)道,題目是《Cell-cell adhesion in plant gra...
今天分享一篇我們自己的文章。發(fā)在《Journal of Nanobiotechnology》的題目為:“Carbon nanosol-induced assemblage o...
今天分享一篇,最近發(fā)在Nature Ecology & Evolution的paper:Microbe-induced phenotypic variation leads ...
最近,中國農(nóng)業(yè)大學(xué)在Nature Communications發(fā)表了題為“Decoding the gene regulatory network of endosperm ...
最近,雜交水稻全國重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在Nature Communications發(fā)表了題為“Microbiome homeostasis on rice leaves is regu...
今天分享一篇做植物單細(xì)胞進(jìn)化分析方面的文章,動物里面看過好幾篇經(jīng)典的給予單細(xì)胞數(shù)據(jù)的進(jìn)化分析,植物里面還見的比較少,也就是偶爾在一些文章里面做下比如擬南芥和水稻的比較分析而已...
今天學(xué)習(xí)另外一個(gè)轉(zhuǎn)錄因子活性預(yù)測工具:DoRothEA。很多文章用的也是這個(gè)工具,看起來比pySCENIC好像快很多。其實(shí),單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子分析本質(zhì)上是計(jì)算一種specific...
今天分享一篇發(fā)表在NBT上的一篇叫做“Spatial metatranscriptomics resolves host-bacteria-fungi interactome...
今天我們嘗試復(fù)現(xiàn)一個(gè)熱圖,下面圖C的右邊部分。 下載附表的原始數(shù)據(jù)。 首先加載需要的包: library(xlsx) library(ComplexHeatmap) libr...
今天分享一篇發(fā)表在MP上面的一個(gè)paper,是中國科學(xué)院分子植物科學(xué)卓越創(chuàng)新中心發(fā)表的,題目為"Single-cell RNA sequencing reveals a hi...
光是植物生長發(fā)育最重要的調(diào)控因子,不僅為植物提供能源,還作為信號因子調(diào)控植物發(fā)育的整個(gè)生活史。其中,光、暗條件下幼苗的形態(tài)建成是光信號調(diào)控植物發(fā)育最顯著的表現(xiàn)形式:暗中生長的...
土壤鹽堿化問題日益嚴(yán)峻,已經(jīng)成為全球范圍內(nèi)制約植物生長發(fā)育的主要環(huán)境因子之一。根系在植物應(yīng)答逆境脅迫中具有重要的調(diào)節(jié)作用,作為環(huán)境脅迫下最先感知并作出反應(yīng)的器官,其耐逆機(jī)理還...
植物病害對全球糧食安全構(gòu)成了重大威脅,了解植物疾病發(fā)生機(jī)制,對制定有效的病原菌防御策略具有重大影響。但是,由于病原菌在宿主體內(nèi)是一個(gè)動態(tài)過程,不同植物細(xì)胞和組織對病原菌的精確...