背景 看到很多高分文章中都包含這種多個通路富集的圖,很直觀的表現(xiàn)出富集的大類功能通路,形式也十分美觀,已有aPEAR,emapplot等包/函數(shù)...
一、基礎背景 根據(jù)研究對象和目的的不同,選擇后續(xù)進行胚系突變還是體細突變的分析。 定義: 胚系突變是發(fā)生在生殖細胞(精子和卵子)中,由父親的精子...
使用一個數(shù)據(jù)樣本(EXON_FYY_1.fastq.gz,EXON_FYY_2.fastq.gz)作為示例,樣本多可以寫成循環(huán)。 Step 0:...
一、全外顯子組 vs 全基因組概念 1. 測序范圍 全外顯子測序(WES) 僅針對基因組中外顯子區(qū)域(約占全基因組的1-2%),即能夠編碼蛋白質...
將SRA文件轉成fastq文件可以用fasterq-dump或者parallel-fastq-dump,其中parallel-fastq-dum...
簡介 Drug2Cell 是用于scanpy中基因組活性評估的效用函數(shù)的集合,既用于每個細胞評分,也用于基于標記的富集/過表示分析。Drug2c...
《動物學科學研討》課程老師讓介紹一種測序技術,及其在動物學上的應用的,PPT共享! (每帖分享:時間應該被用在有價值且讓你快樂的地方,而不是無意...
在使用FeaturePlot畫圖的時候會因為細胞太多存在一些細胞被覆蓋的現(xiàn)象,導致表達某基因的細胞由于處于底層而展示不出來。我們如果想要讓表達特...
1.軟件和參考基因組文件下載 cellranger下載 建議下載比較新的的,我這個是因為想和原文保持一致所以才下載的老版本官網下載:https:...