筆記內(nèi)容：由二代測序產(chǎn)生的序列數(shù)據(jù)（.fastq）到OTU table， 距離矩陣，物種多樣性指數(shù)，序列的進化樹及物種注釋信息的可分析數(shù)據(jù)，為常規(guī)分析流程?？梢允褂胾sear...
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微生物組16S rRNA數(shù)據(jù)分析小結(jié)：從OTU table到marker物種 -
基于R語言的微生物群落組成多樣性分析——CCA分析????之前文章中我們講到過冗余分析（redundancy analysis, RDA），今天我們來講另一種分析——典范對應分析（canonical corresponden...
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當你用setwd的時候，能考慮一下Rproject的感受嗎
我在線下課程中講過，R語言文件讀取只有一個報錯，就是： 傳統(tǒng)的R語言書和課程里會講，setwd（）這個命令是設置工作目錄用的，所謂工作目錄就是圖片導出、腳本保存、數(shù)據(jù)讀取的默...
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ANI AAI TETRA Mash比較基因組導讀 比較平均核酸一致性average nucleotide identity（ANI）和氨基酸一致性amino acid identity（AAI）是比較基因組常用的兩種基...
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5-【ANI、AAI、dDDH】的安裝和使用（2021.2.4）
安裝時間：2021.2.4 1. 簡介 目前原核生物常用的分的界定標準有三種，包括基因組之間的平均氨基酸均一性（Average Nucleotide Identity, AN...
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有道云筆記網(wǎng)頁剪報 Chrome插件-登錄問題問題描述：Chrome 網(wǎng)頁剪報收藏筆記每次都需要登錄且剪報收藏失敗報錯登錄后，再點擊收藏時報如下錯誤：{canTryAgain: false,scope: "SECURIT...
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使用Windows做生信 | WSL生信分析環(huán)境搭建
以前聯(lián)系linux都是安裝虛擬機，不過現(xiàn)在微軟發(fā)布了Windows子系統(tǒng)（WSL），使我們可以非常方便地獲得linux環(huán)境，進行聯(lián)系甚至用于實際的工作和生產(chǎn)中。下面，就讓我們...
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更新R version 4.0.0 后安裝配置Rtools（第一次發(fā)帖，任何問題請見諒，后續(xù)會不斷改進） 1. R 4.0.0的更新 采用《R語言實戰(zhàn)》第2版附錄中的方法更新，即安裝“installr”包進行更新。 會自動彈出鏡像選...
