現(xiàn)在可以用fasterq-dump, 速度更快，請閱讀都8102年了，還用fastq-dump，快換fasterq-dump吧 做生信的基本上都跟NCBI-SRA打過交道,尤...
發(fā)簡信
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Fastq-dump: 一個神奇的軟件 -
三代測序入門移步github 測序原理 共有的特點： 優(yōu)點：無需前期擴(kuò)增，不引入偏向性；讀長長缺點：錯誤率高； 10X Genomics：Illumina二代測序的升級版 10X Gen...
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學(xué)會正確選擇多序列比對（coding-sequences）軟件前幾天，實驗室的師弟師妹通過本地blast獲取一些沒有基因組注釋物種的蛋白編碼序列。原本以為可以快速地進(jìn)行下一步的選擇壓力分析，沒想到卻在多序列比對這一環(huán)節(jié)出現(xiàn)了棘手的問題。...
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mcmctree估算物種分歧時間推斷物種系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系以及分歧時間對探討物種起源與演化具有重要意義。通過最大似然法（ML）構(gòu)建物種進(jìn)化樹以及估算物種分化時間在比較基因組學(xué)的研究進(jìn)展中已經(jīng)成為了必不可少的“套路...
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相見恨晚的15個 Linux 神器，你可能一個都沒見過
作者 | int32bit 出處｜知乎回答原文 | http://t.cn/R1FKgdN ag：比grep、ack更快的遞歸搜索文件內(nèi)容。 tig：字符模式下交互查看git...
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對比了 Python、Go 和 Rust 之后，我們得出了這個結(jié)論本文主要是從 Python 開發(fā)者的角度基于開發(fā)工效學(xué)對這三種語言進(jìn)行的一個比較，你可以跳過討論部分，直接查看代碼示例、性能比較、主要結(jié)論或 Python、Go 和 Rust...
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【思考】學(xué)習(xí)生信是一段孤獨的旅程
ps：更新于2019/4/27 境由心造：意識思維的局限而已 這篇文章只是一時的吐槽而已，真實情況是一起的學(xué)習(xí)的小伙伴病了好久，沒人學(xué)習(xí)交流，一時興起。本人一直很陽光積極向上...
個人介紹
常居中國南方的 化學(xué)生物狗一只，現(xiàn)在溜去CUHK讀博去了，從事生物信息的工作。常用語言 python、R、javascript，熟練使用python的工程師一枚。