一、舉例回顧 本節(jié)所使用GSE1009數(shù)據(jù)集，已經(jīng)用limma包進(jìn)行差異分析，現(xiàn)對DEGs做GO富集分析。 GSE1009數(shù)據(jù)集介紹： 樣本量：共6個樣本，其中后3個為糖尿病...
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15.KEGG富集分析R語言代碼及5種圖的繪制 -
s'###'就不用轉(zhuǎn)義了
Linux環(huán)境變量PATH的增添和刪除操作
Linux設(shè)置環(huán)境變量 我在linux系統(tǒng)中執(zhí)行ifconfig命令，顯示無法執(zhí)行，說什么不在PATH中無法定位，所以無法執(zhí)行。所以我們就要把ifconfig的路徑加入到PA...
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遇到了同樣的問題， 可以看最新文檔https://satijalab.org/signac/articles/pbmc_vignette.html
使用Signac包進(jìn)行單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)分析（一）：Analyzing PBMC scATAC-seq
Signac是Seurat的一個擴展功能R包，可以用來分析、解釋和探索單細(xì)胞染色質(zhì)數(shù)據(jù)集。目前，Signac包主要專注于分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)，之后還會添加其他基于染...
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使用Signac包進(jìn)行單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)分析（一）：Analyzing PBMC scATAC-seq
Signac是Seurat的一個擴展功能R包，可以用來分析、解釋和探索單細(xì)胞染色質(zhì)數(shù)據(jù)集。目前，Signac包主要專注于分析單細(xì)胞ATAC-seq數(shù)據(jù)，之后還會添加其他基于染...
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寫的真好。。
單細(xì)胞免疫組庫：TCR基因重排原理和TCR測序建庫方法
單細(xì)胞測序方法和原理系列： 1. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組建庫原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[http://www.itdecent.cn/p/6c5d...
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單細(xì)胞免疫組庫：TCR基因重排原理和TCR測序建庫方法單細(xì)胞測序方法和原理系列： 1. 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組建庫原理：SMART、TargetAmp和10X genomics[http://www.itdecent.cn/p/6c5d...
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這個世界流行離開，但我們卻不擅長告別
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@周運來就是我 看到了，最小生成樹的節(jié)點
scRNA-seq擬時分析 || Monocle2 踩坑教程
擬時（pseudotime）分析，又稱細(xì)胞軌跡（cell trajectory）分析，通過擬時分析可以推斷出發(fā)育過程細(xì)胞的分化軌跡或細(xì)胞亞型的演化過程，在發(fā)育相關(guān)研究中使用頻...
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請問軌跡分析以后得到的Y_1,Y_2...Y_n是軌跡上的坐標(biāo)嗎？
scRNA-seq擬時分析 || Monocle2 踩坑教程
擬時（pseudotime）分析，又稱細(xì)胞軌跡（cell trajectory）分析，通過擬時分析可以推斷出發(fā)育過程細(xì)胞的分化軌跡或細(xì)胞亞型的演化過程，在發(fā)育相關(guān)研究中使用頻...
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將Shiny APP搭建為獨立的桌面可執(zhí)行程序 - Deploying R shiny app as a standalone application起源！ 某天，我發(fā)現(xiàn)了Shiny這個東西，當(dāng)時興沖沖的嘗試官網(wǎng)上各種各樣的例子，最后發(fā)現(xiàn)這個東西似乎只能充當(dāng)一個“玩具”。如果要在本地運行，它需要一個完整的R環(huán)境，這對相當(dāng)一...
