EMMAX是關(guān)聯(lián)分析速度提升的一個(gè)代表性算法, 已廣泛應(yīng)用于棉花、大豆和水稻等的復(fù)雜性狀關(guān)聯(lián)分析。EMMAX認(rèn)為，每一個(gè)SNP對復(fù)雜性狀的解釋率都很低，每個(gè)組件的方差在運(yùn)算中...
IP屬地：廣西
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9.3 GWAS：關(guān)聯(lián)分析——EMMAX -
轉(zhuǎn)錄組測序分析-上游分析一、認(rèn)識轉(zhuǎn)錄組 RNA作為基因組和蛋白質(zhì)組之間的鏈接部分，是分子生物學(xué)中獨(dú)特的核心活動(dòng)。轉(zhuǎn)錄組測序是分析某一組織中的全部RNA的表達(dá)量，包括mRNA,rRNA,tRNA,ln...
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挑選ssGSEA的基因集繪制基因熱圖
首先加載相應(yīng)的包 然后找到感興趣的通路的基因集 讀取TPM格式的數(shù)據(jù) 準(zhǔn)備好分組信息 準(zhǔn)備繪圖用的數(shù)據(jù) 指定繪圖用的顏色并繪制熱圖
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利用ggplot繪制火山圖和ggrepel標(biāo)記特定基因
學(xué)習(xí)來源生信技能樹課程以及sthda學(xué)習(xí)網(wǎng)站http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-essentials[http://www.s...
