寫在前面 目前,github 應(yīng)是生信軟件擺放的主流倉庫。比如我們熟悉的TBtools, Seqkit,IGV等等。當(dāng)然,甚至很多時(shí)候,我們會(huì)發(fā)現(xiàn)一些高水平的分析類文章直接講...
請問你這個(gè)count文件,是raw count還是DESEQ2標(biāo)準(zhǔn)化之后的count
生信小白教程之Count轉(zhuǎn)TPM,F(xiàn)PKM相信很多科研工作者(不包括比我厲害的大佬們)在做轉(zhuǎn)錄組時(shí),都是在公司做測序,然后數(shù)據(jù)也交給公司分析,又然后,期待做個(gè)差異分析,得出像下圖那么完美的熱圖。 然而,然而,,我們得...
今天繼續(xù) 跟著Nature Communications學(xué)畫圖系列第四篇。學(xué)習(xí)R語言ggplot2包畫散點(diǎn)圖,然后分組添加擬合曲線。對應(yīng)的是論文中的Figure2 對應(yīng)的 N...
samtools用conda 剛安好是可用的,但是裝了其他一些軟件后就有可能報(bào)錯(cuò) 解決方案: 原理 這個(gè)問題在github issue中很多人提到,samtools開發(fā)者說這...
載入數(shù)據(jù) mycounts<-read.csv("2020武漢加油.csv")head(mycounts)rownames(mycounts)<-mycounts[,1]my...