fasterq-dump 人多力量大，核多干飯香 最近開始入門生信，第一次感覺到自己的頭發(fā)可能要離自己遠(yuǎn)去了。 作為濕實(shí)驗(yàn)的大佬（自封），自然是沒有什么服務(wù)器的，所以我開始了...
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【小工具】智能合并測(cè)序數(shù)據(jù)fastq的腳本
介紹： 這是一個(gè)可以自動(dòng)合并數(shù)據(jù)的簡(jiǎn)易腳本 應(yīng)用場(chǎng)景： 有一批數(shù)據(jù)有三十幾個(gè)樣本,測(cè)序公司返回?cái)?shù)據(jù)時(shí)由于數(shù)據(jù)量不達(dá)標(biāo)，需要加測(cè)一次，部分樣本數(shù)據(jù)量還是不夠, 又加測(cè)一次才夠，...
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R 中如何快捷輸入%in%
在 RStudio 中，前往 Tools > Global Options > Code > Edit Snippets。snippet in ${2} %in% ${1}找...
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hdWGCNA：將單細(xì)胞和空間轉(zhuǎn)錄組的WGCNA分析變成現(xiàn)實(shí)前言 Immugent最近讀到了一篇非常炸裂的文獻(xiàn)，篇名為：High dimensional co-expression networks enable discovery ...
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單細(xì)胞數(shù)據(jù)處理小細(xì)節(jié)匯總1. Seurat對(duì)象查看當(dāng)前的Assay 在進(jìn)行了SCTransform操作后，矩陣默認(rèn)會(huì)變成SCT矩陣，如果不加設(shè)置，后續(xù)的PCA等操作都是基于SCT矩陣。修改Defau...
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“我不想24歲了，還花家里的錢”
今天接到一個(gè)小姑娘的咨詢，她問我的公眾號(hào)有沒有兼職可以提供，她可以做一些簡(jiǎn)單的下游分析賺點(diǎn)外快。 我說沒有呀。 科研服務(wù)是個(gè)苦差事 其實(shí)倒是經(jīng)常有一些讀者來求助，想要找我們做...
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scale函數(shù)對(duì)矩陣歸一化是按行歸一化，還是按列歸一化？提出這個(gè)問題是在R package：circlize環(huán)狀熱圖[http://www.itdecent.cn/p/300e00fe61b6]需要對(duì)某個(gè)矩陣進(jìn)行歸一化處理，雖然...
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暫別簡(jiǎn)書，后會(huì)有期
我不是老師，也不是大神，更不是前輩。我只是個(gè)普通的科研工作者，一個(gè)只想努力變得更好的人。 來到簡(jiǎn)書快3年了，期間寫了不少的筆記。很多的筆記是在疫情嚴(yán)重時(shí)wfh的時(shí)候?qū)懙?。至?..
