比較基因組學(xué)分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計(jì)算分化時(shí)間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析[ht...
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比較基因組學(xué)分析2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析 -
比較基因組學(xué)分析3：特異節(jié)點(diǎn)基因家族富集分析（非模式物種GO/KEEG富集分析）比較基因組學(xué)分析目錄 1：單拷貝基因構(gòu)建物種樹以及計(jì)算分化時(shí)間[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]2：基因家族收縮與擴(kuò)張分析[ht...
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節(jié)點(diǎn)、cpu、cpu核、進(jìn)程、線程
1. 一個(gè)CPU有多個(gè)核心（物理核心），接觸到的服務(wù)器叫做節(jié)點(diǎn)，一個(gè)節(jié)點(diǎn)也可以有1-多個(gè)CPU，1個(gè)CPU有多個(gè)CPU核心，大多數(shù)計(jì)算服務(wù)器都是2個(gè)CPU的。 進(jìn)程：進(jìn)程是程...
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不積跬步，無以至千里。
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西澳大學(xué)生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因組與群體基因組學(xué)的挖掘<br><br>簡信不回答問題，有問題發(fā)至<br>lakeseafly50@gmail.com
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群體遺傳學(xué)習(xí)筆記-基礎(chǔ)知識
群體遺傳學(xué)介紹 傳統(tǒng)群體遺傳學(xué)是基于觀察到的等位基因頻率與預(yù)期頻率的分析。例如，在Wright-Fisher模型下，你可能會看到有性繁殖的二倍體個(gè)體群體，而且這些種群沒有重疊...
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SRA下載數(shù)據(jù)及轉(zhuǎn)化為fastq方法可參考http://www.itdecent.cn/p/0694fcb77157[http://www.itdecent.cn/p/0694fcb77157]的四種下載方...
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服務(wù)器設(shè)置使用的最大內(nèi)存
通常一個(gè)節(jié)點(diǎn)的內(nèi)存在250G左右，若不設(shè)置運(yùn)行內(nèi)存，則會默認(rèn)250G，當(dāng)設(shè)置核心數(shù)過少時(shí)，可能會被分配到某個(gè)含空閑核心數(shù)不多的節(jié)點(diǎn)，該節(jié)點(diǎn)內(nèi)存亦不多，因此可能會導(dǎo)致任務(wù)被殺死...
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查看cpu使用情況
一、總cpu使用查看 Linux中Swap（即交換分區(qū)）：類似于Windows的虛擬內(nèi)存，就是當(dāng)內(nèi)存不足的時(shí)候，把一部分硬盤空間虛擬成內(nèi)存使用,從而解決內(nèi)存容量不足的情況。A...
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生信阿拉丁，為實(shí)用而生
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兩臺服務(wù)器間的數(shù)據(jù)傳輸方式
兩臺Linux服務(wù)器[https://www.zhihu.com/search?q=Linux%E6%9C%8D%E5%8A%A1%E5%99%A8&search_sourc...
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測序中Q20 Q30 Q40
二代測序中，每測一個(gè)堿基會給出一個(gè)相應(yīng)的質(zhì)量值，這個(gè)質(zhì)量值是衡量測序準(zhǔn)確度的。堿基的質(zhì)量值13，錯(cuò)誤率為5%，20的錯(cuò)誤率為1%，30的錯(cuò)誤率為0.1%。行業(yè)中Q20與Q30...
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關(guān)于K-mer
1.什么是K-mer? mer: 分子生物學(xué)領(lǐng)域中意義為：monomeric unit ( mer) ：單體單元，相當(dāng)于nt或者bp。通常用于雙鏈核酸中的單位，100 mer...
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測序Q20，Q30介紹
高通量測序中每測一個(gè)堿基都會給出一個(gè)對應(yīng)的質(zhì)量值，這個(gè)質(zhì)量值是衡量測序準(zhǔn)確度的，20的錯(cuò)誤率為1%，30的錯(cuò)誤率為0.1%。行業(yè)中Q20與Q30則表示質(zhì)量值≧20或30的堿基...
