作業(yè)要求: 根據(jù)給定的兩個(gè)數(shù)據(jù)文件genefile.txt(基因表達(dá)譜)和geneid(基因ID號(hào)),利用熵值評(píng)價(jià)各個(gè)基因的表達(dá)穩(wěn)定性,并找出前10個(gè)表達(dá)最不穩(wěn)定的基因(可能...
數(shù)據(jù)來源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE54236[https://www.ncbi.nlm.n...
經(jīng)常有小伙伴問如何繪制下圖這樣代謝通路與熱圖的組合圖,其中的代謝通路一般都需要經(jīng)過“簡化合并”,而熱圖一般使用通路中部分關(guān)鍵基因的表達(dá)量差異倍數(shù)(Log2FC)進(jìn)行繪制,這樣...
GO和Pathway富集分析是功能分析不可或缺的一部分,GO和Pathway富集分析結(jié)果的展示也是五花八門:條形圖,氣泡圖,山脊圖等等。由于GO分成三部分:生物過程(Biol...
歡迎關(guān)注R語言數(shù)據(jù)分析指南 最近看到一張非常有意思的圖,暫且稱之為餅狀熱圖,與corrplot所繪制的有所不同此圖使用的為離散型變量,例圖如下所展示;由于作者未提供原始數(shù)據(jù),...
title: "m6A-LGG-week1"author: "Hannisal"date: "2020/10/3" 1.TCGA的數(shù)據(jù)下載 用TCGA官網(wǎng)的GDC工具下載,需...
單細(xì)胞繪圖系列: Seurat繪圖函數(shù)總結(jié)[http://www.itdecent.cn/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2優(yōu)化Seurat繪圖[https...