寫在前面 small RNA測(cè)序之后，會(huì)得到很多不同類型的小RNA數(shù)據(jù)，其中包括我們常常并不感興趣的RNA類型，比如rRNA區(qū)間產(chǎn)生的小RNA。有必要準(zhǔn)備一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)，用于過(guò)濾...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：湖南
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制備用于smallRNA分析的RNA過(guò)濾庫(kù)
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WGCNA（6）：篩選 hub gene通過(guò)前期的分析，我們確定了感興趣的module，但是module中又含有幾十甚至上百的基因，下一步需要進(jìn)一步篩選hub gene。 WGCNA（3）：基因模塊與性狀關(guān)聯(lián)識(shí)別重...
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測(cè)序了，然后呢（四）有了OrgDb才能進(jìn)行富集分析劉小澤寫于19.1.20-21要進(jìn)行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每個(gè)基因?qū)?yīng)什么樣的GO/KEGG分類，OrgDb就是存儲(chǔ)不同數(shù)據(jù)庫(kù)基因ID之間對(duì)應(yīng)關(guān)系，以及基因與G...
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Orthofinder 2.3Homolog是同源基因。 Orthologs,Orthologues 直系同源，是指不同物種之間的基因，起源于共同的祖先，基因功能可能一樣，但又因?yàn)檫M(jìn)化的關(guān)系，使得功能有...
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系統(tǒng)發(fā)育（Phylogeny）簡(jiǎn)介重建系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系=分子數(shù)據(jù)建樹(shù)？ 一提到phylogeny，我們的第一反應(yīng)就是分子數(shù)據(jù)建樹(shù)。這種理解是片面的，但也反映了一些它的分類學(xué)的區(qū)別： 首先，分類學(xué)在根據(jù)charac...
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個(gè)人向ggplot2箱線圖總結(jié)主要從如何看圖、用圖與作圖三個(gè)方面來(lái)對(duì)箱線圖進(jìn)行理解和總結(jié)。 1、看圖 如圖所示，箱線圖是將一組數(shù)據(jù)按照大小順序排列后進(jìn)行繪制的，包含6個(gè)數(shù)據(jù)節(jié)點(diǎn)，分別表示出數(shù)據(jù)的上邊緣、上...
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PyCharm：template（文件模板）設(shè)置本文主要介紹PyCharm中文件template設(shè)置。 打開(kāi)PyCharm設(shè)置界面，搜索template，選擇File and Code Templates--Python ...
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利用orthofinder尋找單拷貝基因構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)新的系列系列教程[http://www.itdecent.cn/p/10bb4410ae3d]已上傳，大家可以去看新的教程 1.orthofinder介紹 OrthoFin...
