最近一周開始學(xué)習(xí)ATAC數(shù)據(jù)分析,目前只是嘗試了簡(jiǎn)單分析,新手小白,如果有小失誤歡迎留言~ 1.準(zhǔn)備環(huán)境 創(chuàng)建conda環(huán)境(如果已有成熟環(huán)境不需再次創(chuàng)建) 激活環(huán)境 2.安...
最近一周開始學(xué)習(xí)ATAC數(shù)據(jù)分析,目前只是嘗試了簡(jiǎn)單分析,新手小白,如果有小失誤歡迎留言~ 1.準(zhǔn)備環(huán)境 創(chuàng)建conda環(huán)境(如果已有成熟環(huán)境不需再次創(chuàng)建) 激活環(huán)境 2.安...
1. 整合不同數(shù)據(jù)集中同一類細(xì)胞方法: 該方法來自一篇21年5月份的Nature:Cross-tissue organization of the fibroblast li...
數(shù)據(jù)全部來自微信公眾號(hào):生信小知識(shí),感謝生信小知識(shí)提供的學(xué)習(xí)平臺(tái) 準(zhǔn)備數(shù)據(jù)test.csv 安裝R包 載入環(huán)境 準(zhǔn)備測(cè)試數(shù)據(jù) 數(shù)據(jù)格式調(diào)整 NOTE:表中數(shù)據(jù)整合為種結(jié)構(gòu)化的...
本篇數(shù)據(jù)完全來源公眾號(hào)“老俊俊的生信筆記” 數(shù)據(jù)來自參考文檔:https://github.com/junjunlab/tackPlotR/wiki[https://gith...
此次學(xué)習(xí)的m6A/MeRIP-seq 適合單個(gè)細(xì)胞樣本或者bulk樣本 work flow 需要用到的包: Cutadapt, tested with 1.15Samtool...
準(zhǔn)備數(shù)據(jù)文件.txt 這里準(zhǔn)備的是BMI.txt(依舊是自己準(zhǔn)備的數(shù)據(jù)) 繪制小提琴圖: 小提琴圖添加箱線圖: 由于沒有合適的數(shù)據(jù),會(huì)出來的圖有些許怪,主要關(guān)注繪圖的方法~
馬上放假了,今天我們來點(diǎn)基礎(chǔ)的東西,畫圖的操作。 不想要這么丑的圖。圖片 要優(yōu)雅的輸出結(jié)果 圖片 「ggplot2中柱狀圖基本繪制函數(shù)常用geom_bar()」 參數(shù)介紹: ...
單細(xì)胞分析流程之Cell Ranger結(jié)果解讀 各位小伙伴大家好! 上期我們說到了Cell Ranger的下載、安裝以及常規(guī)的使用方法,這期我們就來了解讀一下這些結(jié)果吧~ 0...