更新于2020.10.27 二代測(cè)序方式分為三種：single read 單端測(cè)序paired-end read 雙端測(cè)序mate-pair read 配對(duì)測(cè)序 雖然有三種方...
發(fā)簡(jiǎn)信
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WGS分析筆記（1）—— 原始數(shù)據(jù)以及質(zhì)控 -
WGS全流程的學(xué)習(xí)筆記
Part1 數(shù)據(jù)下載 先去Korean Personal Genome Project下載了編號(hào)為KPGP-00001的數(shù)據(jù)。 先說一下KPGP吧，中文名叫韓國(guó)個(gè)人基因組計(jì)...
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全基因組分析實(shí)踐（參考：堿基礦工）參考：堿基礦工從零開始完整學(xué)習(xí)全基因組測(cè)序數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實(shí)踐（上） 前言 由于人類基因組數(shù)據(jù)過大（我的小小服務(wù)器也只有50...
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轉(zhuǎn)錄組入門（3）：質(zhì)量控制需要用安裝好的sratoolkit把sra文件轉(zhuǎn)換為fastq格式的測(cè)序文件，并且用fastqc軟件測(cè)試測(cè)序文件的質(zhì)量！作業(yè)，理解測(cè)序reads，GC含量，質(zhì)量值，接頭，in...
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R語言20練習(xí)題【完整版】劉小澤重新寫于2018.9.3練習(xí)題來自生信技能樹jimmy，http://www.bio-info-trainee.com/3409.html再次基礎(chǔ)上進(jìn)行加工、重構(gòu)，加入...
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R語言中的%in%操作符是干什么的？
判斷前面一個(gè)向量?jī)?nèi)的元素是否在后面一個(gè)向量中，返回布爾值。 代碼實(shí)例 可以使用這個(gè)語法提取向量a中的值
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R語言轉(zhuǎn)錄組分析-GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載及Illumina數(shù)據(jù)處理一、簡(jiǎn)單認(rèn)識(shí)一下GEO數(shù)據(jù)庫(kù) 入口：在NCBI主頁 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 的搜索入口輸入關(guān)鍵字，比如某個(gè)基因或某個(gè)疾病，選擇數(shù)據(jù)類型為GE...
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【轉(zhuǎn)】生物信息(bioinformation)學(xué)名詞解釋
什么是高通量測(cè)序？ 高通量測(cè)序技術(shù)（High-throughput sequencing，HTS）是對(duì)傳統(tǒng)Sanger測(cè)序（稱為一代測(cè)序技術(shù)）革命性的改變, 一次對(duì)幾十萬到幾...
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R 小白筆記 | R語言最基本函數(shù)
管理工作區(qū)的函數(shù) 幫助函數(shù) 輸入和輸出函數(shù) 包 包的安裝 包的載入 包的相關(guān)信息 參考資料 R in Action, Second Edition
