劉小澤寫于2020.2.6最近再一次做起了轉(zhuǎn)錄組,但這一次需求有點小改變,需要自己定制一下,具體原因看本文吧。其中要特別表揚花花??同學,幫了個大忙! 問題由來 我們一般進行富...
劉小澤寫于2020.2.6最近再一次做起了轉(zhuǎn)錄組,但這一次需求有點小改變,需要自己定制一下,具體原因看本文吧。其中要特別表揚花花??同學,幫了個大忙! 問題由來 我們一般進行富...
劉小澤寫于19.7.9+12-第二單元第十講:RPKM概念及計算方法筆記目的:根據(jù)生信技能樹的單細胞轉(zhuǎn)錄組課程探索smart-seq2技術(shù)相關(guān)的分析技術(shù)課程鏈接在:http:...
一個基因在不同的數(shù)據(jù)庫有不同的名字:1.Entrez gene ID:我們一般說的Gnen ID即Entrez gene ID,是用一串數(shù)字表示的(在NCBI里面用)2.Ge...
在我們進行組學數(shù)據(jù)分析或者看別人給我們的數(shù)據(jù)報告的時候,經(jīng)常會看到諸如ENSG00000141738 之類的名稱,面對這樣的名稱,我們往往是得不到任何信息的,更不可能把這樣的...
參考文獻:stringtie enables improved reconstruction of a transcriptome from rNA-seq reads幫助文...
水滴石穿,非一日之功 本期內(nèi)容同時發(fā)布于單細胞天地微信公眾號。 在進行單細胞分析時,非常重要的一步就是聚類分群,而在這個過程當中經(jīng)常令人困惑的是如何選擇一個合適的分辨率(re...
最近想使用文獻中的數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn)每篇文獻提供的數(shù)據(jù)格式都不太一樣,創(chuàng)建seurat對象會遇到一些問題。以標準的輸入文件為例,命名為barcodes.tsv.gz、feature...
Basic Statistics 基本信息 Encoding: 測序平臺編號,現(xiàn)在Sanger/ Illumina 1.8以上都是Phred 33編碼 Total sequ...