發(fā)簡信
IP屬地：湖南
-
trim_galore 報(bào)錯(cuò)以及解決今天在跑smart-seq2數(shù)據(jù)的上游，突然發(fā)現(xiàn)有一個(gè)trim_galore處理過的文件命名不太一樣，其他文件命名都類似‘SRR19781608...
-
生信云服務(wù)器跑hisat2報(bào)錯(cuò)以及解決
用conda安裝hisat2后一直出現(xiàn)如下報(bào)錯(cuò) 我首先讀取了對應(yīng)報(bào)錯(cuò)文件的內(nèi)容 發(fā)現(xiàn)該文件內(nèi)確實(shí)缺少了'GLIBCXX 3.4.26'和'GLI...
-
科研小白學(xué)習(xí)筆記：從GitHub安裝R包報(bào)錯(cuò)-1
最近從GitHub安裝R包時(shí)經(jīng)常會(huì)報(bào)錯(cuò)： 在網(wǎng)上查找后發(fā)現(xiàn)好像是從GitHub安裝R包經(jīng)常會(huì)出現(xiàn)的問題，與代碼無關(guān)。并且很多時(shí)候過一段時(shí)間再安裝...
-
科研小白學(xué)習(xí)筆記：.bashrc文件損壞，linux?無法激活環(huán)境因?yàn)槊看芜\(yùn)行cellranger都要重新執(zhí)行： export PATH=/home/data/｛用戶名｝/sys_soft/cellranger...
-
科研小白學(xué)習(xí)筆記：conda虛擬環(huán)境下安裝上游分析需要的包
我使用的安裝代碼是 nohup conda install -y sra-tools subread hisat2 multiqc trim-g...
-
科研小白學(xué)習(xí)筆記：通過linux服務(wù)器下載sra文件
通過linux服務(wù)器終端下載轉(zhuǎn)錄組測序文件的方式有很多，不同數(shù)據(jù)庫可能需要執(zhí)行不同的下載代碼，我在這簡單梳理一下。（因?yàn)閯偨佑|linux系統(tǒng)...
-
科研小白學(xué)習(xí)筆記：Cre/Loxp條件敲除系統(tǒng)因?yàn)轳R上要進(jìn)組干活，最近一直在看文獻(xiàn)，經(jīng)常遇到使用cre/loxp技術(shù)進(jìn)行條件敲除的文章，看的也是云里霧里，只知道它可以特異性的敲除某類組織內(nèi)的...