主成分分析（Principal component analysis，PCA）是將多個存在相關(guān)關(guān)系的變量，降維為幾個互不相關(guān)的指標(biāo)，也就是主成分。我的數(shù)據(jù)相對來說，有點復(fù)雜，...
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3.表型數(shù)據(jù)：主成分分析 -
全基因組選擇的模型匯總（轉(zhuǎn)載）本文轉(zhuǎn)載自：Bionifarmer[https://www.cnblogs.com/jessepeng/p/14375487.html]。個人感覺非常好。如有侵權(quán)，請聯(lián)系我。...
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3 - BLUP的基本特性及求解方法回顧上一次的一個OLS, GLS，SI, MME的發(fā)展示意圖： MME是Henderson將混合模型的轉(zhuǎn)換得到 1 MME的起源 Henderson提出，其想法是結(jié)合OLS與...
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RIdeogram：染色體數(shù)據(jù)可視化的R包已有的工具如circos, 只能繪制彎的染色體，又如R包chromoMap，IdeoViz，karyploteR，ggbio和在線工具Idiographica，雖然能繪制直的...
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使用RIdeogram繪制染色體圖譜參考文章：http://www.itdecent.cn/p/07ae1fe18071需求描述：我想繪制差異表達(dá)基因在染色體上的分布，或開放染色質(zhì)在染色體上的分布或CTCF在...
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karyoploteR: 畫一個測序深度分布圖??測序深度的分布圖是很常見的一類圖，可用于發(fā)現(xiàn)染色體片段或整條染色體的缺失或是重復(fù)。如果是缺失，測序時捕獲的概率就小，最終比對呈現(xiàn)出來的就是有一段區(qū)域深度明顯偏低；如果是重...
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SNP在染色體上的密度分布圖有兩種方法，先看比較簡單的一種： 結(jié)果： 第二種方法就比較復(fù)雜了，需要準(zhǔn)備兩個文件：一個是包含染色體長度的文件chr_length.txt，格式如下： 一個是包含各個基...
個人介紹
畢業(yè)于山東大學(xué)，具有6年生物信息分析工作經(jīng)驗，一直從事動植物及人的重測序方向。擅長群體重測序及GWAS分析；進(jìn)行過NIPT，CNV，腫瘤ctDNA，遺傳腫瘤等人類健康方向相關(guān)的分析；使用linux，perl，R，git等